25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1344 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  100 
 
 
301 aa  586  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  89.37 
 
 
302 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
800 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  31.05 
 
 
310 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  28.85 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  30.23 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  29.29 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  33.21 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  33.56 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  27.43 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  28.17 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  27.15 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  30.8 
 
 
336 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  27.37 
 
 
309 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  26.95 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  26.95 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  26.95 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  31.36 
 
 
293 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  27.76 
 
 
341 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  27.76 
 
 
341 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  27.76 
 
 
341 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  27.36 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  24.22 
 
 
309 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  27.57 
 
 
286 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  27.78 
 
 
315 aa  43.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.297507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>