159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1035 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1035  chromosome partitioning ATPase-like protein  100 
 
 		 432 aa  877    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0536  chromosome partitioning ATPase  23.2 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.605125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  24.75 
 
 		 390 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20630  hypothetical protein  22.34 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.548267 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  28.57 
 
 		 271 aa  62.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.07 
 
 		 276 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.93 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.07 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.07 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  27.72 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  28.73 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.02 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  27.54 
 
 		 726 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  25.98 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  25.99 
 
 		 273 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  24.26 
 
 		 537 aa  53.5  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  28.25 
 
 		 267 aa  53.5  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0698  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.82 
 
 		 273 aa  53.1  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.6397 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.8 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  22.96 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.04 
 
 		 308 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  28.18 
 
 		 280 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  27.12 
 
 		 260 aa  51.2  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2558  septum site-determining protein MinD  24.05 
 
 		 266 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  26.58 
 
 		 269 aa  50.4  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4346  septum site-determining protein MinD  24.84 
 
 		 264 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000124781  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0376  septum site-determining protein MinD  29.32 
 
 		 266 aa  50.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  26.8 
 
 		 271 aa  50.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.09 
 
 		 270 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.8 
 
 		 395 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  24.76 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  26.71 
 
 		 295 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.46 
 
 		 293 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.45 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  27.33 
 
 		 747 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  24.47 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.12 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  25.29 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.68 
 
 		 287 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.56 
 
 		 271 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.56 
 
 		 274 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  24.24 
 
 		 273 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  23.32 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  23.89 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3422  septum site-determining protein MinD  24.59 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00479465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  24.03 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0679  septum site-determining protein  29.01 
 
 		 269 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0597  septum site-determining protein MinD  29.01 
 
 		 269 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.992631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  23.88 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  25.41 
 
 		 266 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3342  septum site-determining protein MinD  26.06 
 
 		 268 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0366  histidinol phosphatase  30.36 
 
 		 288 aa  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00129205  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  28.35 
 
 		 266 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1436  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 276 aa  47.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  24.86 
 
 		 265 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2129  septum site-determining protein MinD  26.11 
 
 		 265 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000239479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  26.71 
 
 		 267 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03571  putative septum site-determining protein MinD  25.41 
 
 		 271 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.377857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3478  septum site-determining protein MinD  27.49 
 
 		 268 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144531  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  25.93 
 
 		 266 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.57 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.98 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.28 
 
 		 800 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  28.37 
 
 		 365 aa  47.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1940  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 		 270 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  28.75 
 
 		 415 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13170  chromosome partitioning ATPase  24.91 
 
 		 541 aa  46.6  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.768341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3349  septum site-determining protein MinD  28.3 
 
 		 265 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  29.53 
 
 		 373 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  25 
 
 		 264 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  27.27 
 
 		 270 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2768  septum site-determining protein MinD  28.3 
 
 		 265 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.28 
 
 		 290 aa  46.6  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00471356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  24.38 
 
 		 266 aa  46.6  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  26.63 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.33 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  28.07 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21891  putative septum site-determining protein MinD  25.84 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.66 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.25 
 
 		 283 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  27.81 
 
 		 749 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0368  ParaA family ATPase  27.33 
 
 		 289 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3409  septum site-determining protein MinD  28.31 
 
 		 270 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.29 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.26 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.66 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04464  septum site-determining protein MinD  27.95 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.32 
 
 		 281 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.03 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  29.08 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  24.44 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  28.22 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.46 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.17 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  27.95 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0779  chromosome partitioning ATPase  27.78 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000669652  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  28.19 
 
 		 721 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.03 
 
 		 293 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  25.95 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>