More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0966 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0966  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 722 aa  1479    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000592542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12940  heavy metal translocating P-type ATPase  50.56 
 
 		 710 aa  695    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.793876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  39.97 
 
 		 691 aa  521  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.205705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1944  heavy metal translocating P-type ATPase  38 
 
 		 695 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0060  heavy metal translocating P-type ATPase  44.37 
 
 		 752 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1083  heavy metal translocating P-type ATPase  39.63 
 
 		 698 aa  485  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0265246  hitchhiker  0.000000000000296825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1417  heavy metal translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 971 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  37.66 
 
 		 699 aa  465  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1098  heavy metal translocating P-type ATPase  38 
 
 		 693 aa  447  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000158544  hitchhiker  0.0000000000000761512 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06700  heavy metal translocating P-type ATPase  40.1 
 
 		 702 aa  445  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000434785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1752  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 718 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00181407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1346  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 693 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000243263 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3193  heavy metal translocating P-type ATPase  35.33 
 
 		 701 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2577  heavy metal translocating P-type ATPase  36.16 
 
 		 698 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0984175  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1389  tetrapyrrole methylase family protein  33.23 
 
 		 691 aa  342  2e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.512552  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2905  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 712 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.850846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22710  heavy metal translocating P-type ATPase protein  33.77 
 
 		 719 aa  340  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  30.58 
 
 		 716 aa  334  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1377  heavy metal translocating P-type ATPase subfamily protein  33.9 
 
 		 691 aa  332  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0353  metal transporting atpase Mta72  31.1 
 
 		 696 aa  330  4e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.699181  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0831  metal transporting atpase Mta72  30.86 
 
 		 691 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0130757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2796  heavy metal translocatin P-type ATPase  36.44 
 
 		 718 aa  320  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  28.19 
 
 		 698 aa  299  1e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  30.11 
 
 		 718 aa  297  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3620  heavy metal translocating P-type ATPase  32.24 
 
 		 731 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  31.02 
 
 		 712 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  30.85 
 
 		 712 aa  282  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  30.85 
 
 		 712 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  30.66 
 
 		 747 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  31.62 
 
 		 630 aa  275  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  28.93 
 
 		 709 aa  272  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  32.19 
 
 		 639 aa  271  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  30.87 
 
 		 734 aa  271  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  28.43 
 
 		 703 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  32.38 
 
 		 833 aa  266  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  31.48 
 
 		 737 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  32.04 
 
 		 639 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2322  heavy metal translocating P-type ATPase  32.28 
 
 		 637 aa  263  6e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.512408  normal  0.580673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  31.02 
 
 		 783 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  33.9 
 
 		 792 aa  259  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  32.68 
 
 		 734 aa  259  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  30.65 
 
 		 707 aa  258  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  32.41 
 
 		 643 aa  257  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  28.67 
 
 		 751 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  32.22 
 
 		 734 aa  254  6e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2844  heavy metal translocating P-type ATPase  27.35 
 
 		 872 aa  251  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  30.61 
 
 		 805 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  29.17 
 
 		 750 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1042  cation transport ATPase  29.19 
 
 		 620 aa  249  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0059101  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  32.26 
 
 		 713 aa  248  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0498  heavy metal translocating P-type ATPase  30.18 
 
 		 700 aa  248  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2820  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 872 aa  248  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  31.44 
 
 		 797 aa  248  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 		 744 aa  247  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  31.5 
 
 		 712 aa  246  8e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1839  heavy metal translocating P-type ATPase  31.06 
 
 		 625 aa  246  9e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  30.6 
 
 		 738 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  30.31 
 
 		 628 aa  246  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  31.7 
 
 		 679 aa  246  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  29.34 
 
 		 635 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  31.96 
 
 		 673 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  29.74 
 
 		 744 aa  244  5e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  30.81 
 
 		 711 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  30.14 
 
 		 732 aa  243  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  29.9 
 
 		 732 aa  244  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  29.85 
 
 		 732 aa  243  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  34.52 
 
 		 804 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  28.71 
 
 		 812 aa  243  7.999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  30.54 
 
 		 670 aa  243  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  30.26 
 
 		 732 aa  243  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  30.31 
 
 		 732 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  29.9 
 
 		 732 aa  242  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  31.54 
 
 		 675 aa  242  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  30.31 
 
 		 732 aa  242  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  28.85 
 
 		 889 aa  242  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A03  cation transport ATPase  28.79 
 
 		 616 aa  242  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  33.48 
 
 		 793 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  29.76 
 
 		 732 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  30 
 
 		 732 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  32.82 
 
 		 976 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0348  cation transport ATPase  29.74 
 
 		 634 aa  241  2.9999999999999997e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00293849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  30.73 
 
 		 726 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  30.18 
 
 		 678 aa  241  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1344  heavy metal translocating P-type ATPase  28.44 
 
 		 702 aa  240  5e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  27.9 
 
 		 743 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  28.91 
 
 		 889 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  30.37 
 
 		 802 aa  239  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  30.37 
 
 		 802 aa  239  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0981  cation transport ATPase  29.08 
 
 		 633 aa  239  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0546  heavy metal translocating P-type ATPase  30.94 
 
 		 766 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  34.5 
 
 		 795 aa  238  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3501  heavy metal translocating P-type ATPase  29.93 
 
 		 758 aa  238  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.968413 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  32.4 
 
 		 773 aa  238  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  30.29 
 
 		 728 aa  238  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  28.77 
 
 		 844 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 767 aa  237  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  29.51 
 
 		 828 aa  236  8e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  31.66 
 
 		 907 aa  236  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  30.65 
 
 		 637 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  30.36 
 
 		 699 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>