45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0635 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  31.93 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  33.18 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  29.77 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  28.9 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  32.18 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  27.4 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  25.75 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  27.73 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2369  acyl-ACP thioesterase  27.62 
 
 		 235 aa  92  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111453  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  26.98 
 
 		 249 aa  92  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  27.57 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  27.06 
 
 		 332 aa  90.1  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  24.88 
 
 		 318 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  26.75 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  26.42 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  24.77 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  26.96 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  27.48 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  23.64 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  25.35 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  24.87 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  26.37 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  25 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  25 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1403  Acyl-ACP thioesterase  26.24 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  27.23 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  27.27 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  23 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  26.63 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  26.09 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  24.24 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23720  acyl-ACP thioesterase  23.04 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  23.67 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  26.29 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  23.68 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  23.23 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  24 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  27.96 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  27.11 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 		 130 aa  52  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  26.79 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  18.97 
 
 		 133 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  23.33 
 
 		 156 aa  42.4  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 156 aa  42.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>