256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0632 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0632  thymidylate synthase  100 
 
 		 282 aa  592  1e-168  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1227  thymidylate synthase  64.89 
 
 		 276 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.101938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0188  thymidylate synthase  60.64 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  35.84 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  35.84 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  36.4 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  36.13 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  34.3 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  34.28 
 
 		 285 aa  172  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  36.03 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  34.05 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  34.88 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  34.29 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  32.72 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  32.97 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  34.78 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  34.16 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  34.18 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  33.57 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  35.32 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  34.32 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  33.21 
 
 		 264 aa  165  9e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1527  thymidylate synthase  36.9 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  33.93 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  33.21 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  34.64 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2032  Thymidylate synthase  34.17 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00060457  hitchhiker  0.0000668058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  33.57 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  35.36 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  33.69 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  35.18 
 
 		 264 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  33.57 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  33.57 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  32.85 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  32.85 
 
 		 264 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  37.55 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  33.57 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  32.3 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  33.57 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  32.85 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  33.46 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  33.58 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5002  thymidylate synthase  36.5 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000135835  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  33.45 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  34.17 
 
 		 264 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0622  thymidylate synthase  35.79 
 
 		 286 aa  159  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  33.81 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  34.55 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  35.34 
 
 		 264 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  33.46 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  34.25 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1823  thymidylate synthase  37.25 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10557  hitchhiker  0.00355293 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  33.82 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  33.83 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2311  thymidylate synthase  31.91 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  33.21 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  33.46 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  31.94 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  32.26 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  34.91 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1904  thymidylate synthase  33.68 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1664  thymidylate synthase  35.97 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17460  thymidylate synthase  33.09 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.171384  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0600  Thymidylate synthase  32.49 
 
 		 269 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  34.44 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  32.99 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  31.75 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  32.49 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  35.97 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1450  thymidylate synthase  35.18 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.810743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  32.49 
 
 		 264 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  32.59 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  31.41 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1315  thymidylate synthase  34.27 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.667766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0340  thymidylate synthase  31.4 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  32.85 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1260  thymidylate synthase  33.99 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000721083 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1631  thymidylate synthase  32.98 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  33.69 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  31.41 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  32.67 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1197  thymidylate synthase  32.25 
 
 		 277 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3172  thymidylate synthase  35.43 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  32.01 
 
 		 264 aa  148  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1116  thymidylate synthase  32.25 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5412  thymidylate synthase  32.35 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2772  thymidylate synthase  34.63 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.023604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  30.69 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  31.91 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  32.01 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  33.73 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0442  thymidylate synthase  33.99 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1731  thymidylate synthase  33.99 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  33.57 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  31.43 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1030  thymidylate synthase  34.82 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1581  thymidylate synthase  30.71 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000941291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2051  thymidylate synthase  34.78 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.266097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  32.53 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>