25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3697 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3780  LigA  89.87 
 
 
948 aa  1453    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  87.99 
 
 
948 aa  1453    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  100 
 
 
951 aa  1837    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  50.67 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  28.02 
 
 
1209 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  28.02 
 
 
1209 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  33.61 
 
 
638 aa  63.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  26.57 
 
 
819 aa  61.2  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  30.36 
 
 
1224 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  31.46 
 
 
1224 aa  58.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  31.46 
 
 
1224 aa  58.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 
676 aa  53.9  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  28.83 
 
 
638 aa  53.5  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  31.13 
 
 
818 aa  51.6  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  30.93 
 
 
817 aa  51.6  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  23.08 
 
 
821 aa  50.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  27.88 
 
 
1237 aa  50.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  27.05 
 
 
851 aa  49.3  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  24.44 
 
 
807 aa  48.9  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  24.44 
 
 
826 aa  48.9  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  26.21 
 
 
826 aa  47.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  27.88 
 
 
820 aa  47  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  32.14 
 
 
476 aa  46.2  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  22.96 
 
 
829 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  26.77 
 
 
811 aa  44.3  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>