More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1944 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1944  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
106 aa  200  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2029  50S ribosomal protein L24  99.06 
 
 
106 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.465868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1935  50S ribosomal protein L24  96.23 
 
 
106 aa  194  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1922  50S ribosomal protein L24  75 
 
 
104 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.836798 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  43.43 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  43.43 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  48.86 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  42.31 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  46.91 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  49.38 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  50 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  42.31 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  42.31 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  50.67 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000160911  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0215  50S ribosomal protein L24  49.3 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  43.88 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  46.91 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  41.35 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  46.91 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  49.32 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  46.74 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  41.41 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  49.3 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  44.21 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  53.42 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  37.62 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  38.61 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  38.78 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  41.41 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  43.56 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  51.35 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3994  ribosomal protein L24  50 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  48.75 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  43.21 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1237  50S ribosomal protein L24  45.68 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288274  hitchhiker  0.00079721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  37.62 
 
 
102 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  48.61 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  48.75 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  38.38 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  38.38 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  38.38 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  38.38 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  47.95 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  41.98 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  38.38 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  39.39 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  38.38 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  40.4 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  38.38 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  38.38 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  47.95 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  45.12 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29630  LSU ribosomal protein L24P  51.39 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  45.12 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  38.38 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  45.68 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  45.68 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  44.16 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  47.56 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0302  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
79 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  6.659350000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  38.38 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  45 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  43.24 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  42.22 
 
 
112 aa  60.8  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  40.74 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  47.89 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  41.84 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  45.68 
 
 
106 aa  60.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  41.84 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1847  ribosomal protein L24  46.84 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.095489999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  48.15 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  43.75 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  39.05 
 
 
103 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  40.74 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  38.1 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  38.24 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  40.82 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  42.16 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0334  ribosomal protein L24  47.44 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000366107  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0778  50S ribosomal protein L24  47.95 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0177963  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  38.1 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  41.25 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  41.46 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  42.27 
 
 
118 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  42.27 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  40.51 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  44.05 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  46.34 
 
 
108 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  40 
 
 
105 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  43.9 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  38.61 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  40 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  41.98 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  44.87 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  42.5 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  50.7 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>