26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1875 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1875  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  799    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110835  normal  0.701823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  24.63 
 
 
417 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  23.66 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  22.51 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  22.53 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  22.88 
 
 
398 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  31.48 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  25.9 
 
 
409 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  31.48 
 
 
394 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  32.41 
 
 
394 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  27.6 
 
 
394 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  25.85 
 
 
414 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  36.36 
 
 
304 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  33.01 
 
 
253 aa  56.6  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  27.54 
 
 
402 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6889  hypothetical protein  35.79 
 
 
319 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  24.33 
 
 
417 aa  53.9  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4183  hypothetical protein  27.55 
 
 
348 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0220  hypothetical protein  33.67 
 
 
318 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  26.09 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0164  hypothetical protein  32 
 
 
318 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489222  normal  0.0160984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  32.47 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0022  hypothetical protein  37.29 
 
 
318 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  24.66 
 
 
358 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  26.16 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  27.22 
 
 
454 aa  43.5  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>