More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5452 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  76.97 
 
 		 309 aa  471  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  72.61 
 
 		 312 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  71.9 
 
 		 307 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  71.9 
 
 		 307 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  71.9 
 
 		 307 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  69.64 
 
 		 307 aa  431  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  71.57 
 
 		 307 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  69.84 
 
 		 307 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  70.26 
 
 		 307 aa  421  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  65.02 
 
 		 315 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  63.84 
 
 		 311 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  64.08 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  63.37 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  63.02 
 
 		 312 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  62.83 
 
 		 323 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  64.61 
 
 		 322 aa  368  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  59.55 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  65.16 
 
 		 314 aa  362  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  59.16 
 
 		 327 aa  362  6e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  63.19 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  58.97 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  61.44 
 
 		 306 aa  349  4e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  60.06 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  56.23 
 
 		 321 aa  344  1e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  61.72 
 
 		 319 aa  343  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  61.11 
 
 		 319 aa  339  4e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  60.19 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  55.48 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  57.76 
 
 		 306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  55.48 
 
 		 333 aa  335  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 		 340 aa  332  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  59.15 
 
 		 310 aa  330  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 		 312 aa  326  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  54.1 
 
 		 308 aa  319  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  54.95 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  48.54 
 
 		 314 aa  306  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 309 aa  295  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 		 307 aa  292  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  45.31 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  46.75 
 
 		 315 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  48.73 
 
 		 312 aa  285  7e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  46.28 
 
 		 309 aa  282  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 		 305 aa  281  7.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  45.39 
 
 		 308 aa  281  9e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  46.58 
 
 		 306 aa  280  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  47.84 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  48.03 
 
 		 306 aa  279  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 		 311 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  48.39 
 
 		 311 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 		 298 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  46.05 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  44.3 
 
 		 316 aa  275  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  48.25 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  46.45 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  44.37 
 
 		 302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  47.06 
 
 		 313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  46.45 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  43.88 
 
 		 305 aa  272  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 		 316 aa  271  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 		 316 aa  272  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 		 309 aa  271  8.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  47.28 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  46.65 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  45.42 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  48.22 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  47.1 
 
 		 301 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 		 312 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  47.06 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  42.48 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  45 
 
 		 302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  46.41 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  44.98 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  45.45 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  47.6 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  43.23 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  44.92 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 		 302 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  45.63 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  46.46 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  46.93 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2611  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.183412  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  50.18 
 
 		 309 aa  262  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  44.01 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  43.42 
 
 		 338 aa  262  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  47.6 
 
 		 304 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1573  ornithine carbamoyltransferase  41.58 
 
 		 309 aa  262  4e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0157636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  42.16 
 
 		 316 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0386  ornithine carbamoyltransferase  42.43 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>