42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5444 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  100 
 
 		 918 aa  1672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  70.32 
 
 		 339 aa  305  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  57.34 
 
 		 349 aa  228  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  56.14 
 
 		 355 aa  225  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  59.61 
 
 		 350 aa  204  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  54.79 
 
 		 277 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  54.79 
 
 		 277 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  54.79 
 
 		 277 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  54.79 
 
 		 753 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  53.25 
 
 		 480 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  51.5 
 
 		 680 aa  198  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  53.33 
 
 		 285 aa  195  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  51.26 
 
 		 654 aa  190  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  48.31 
 
 		 640 aa  189  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  51.83 
 
 		 365 aa  188  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  50.46 
 
 		 633 aa  188  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  50.21 
 
 		 305 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  50.51 
 
 		 750 aa  183  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  50 
 
 		 1079 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  54.88 
 
 		 374 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  53.88 
 
 		 675 aa  178  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  53.67 
 
 		 250 aa  173  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  51.83 
 
 		 321 aa  173  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  44.64 
 
 		 618 aa  168  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  49.7 
 
 		 788 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  51.15 
 
 		 341 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  55.43 
 
 		 286 aa  155  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  56.42 
 
 		 227 aa  153  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  50.51 
 
 		 658 aa  142  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  55.72 
 
 		 200 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  42.31 
 
 		 621 aa  134  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  43.72 
 
 		 274 aa  126  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  35.35 
 
 		 591 aa  120  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  32.84 
 
 		 543 aa  115  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2996  pseudouridine synthase, Rsu  42.91 
 
 		 621 aa  77.8  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.772965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  46.91 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  41.38 
 
 		 882 aa  62.8  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  38.11 
 
 		 624 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.97 
 
 		 854 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0364  hypothetical protein  44.04 
 
 		 248 aa  47.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2119  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.09 
 
 		 519 aa  46.6  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  40.69 
 
 		 936 aa  44.3  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>