More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4891 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4891  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 447 aa  865    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0481803  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.12 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.75 
 
 		 437 aa  363  3e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  50.12 
 
 		 431 aa  350  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  48.23 
 
 		 433 aa  345  8e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  49.05 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  49.28 
 
 		 430 aa  342  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  49.88 
 
 		 431 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.88 
 
 		 433 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  48.93 
 
 		 432 aa  338  9e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  50.24 
 
 		 430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  48.22 
 
 		 433 aa  336  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  51.44 
 
 		 432 aa  335  9e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  47.34 
 
 		 462 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  50 
 
 		 435 aa  328  9e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.52 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  50.39 
 
 		 448 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.21 
 
 		 437 aa  327  4.0000000000000003e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  48.08 
 
 		 428 aa  326  6e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  48.36 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  47.96 
 
 		 454 aa  323  4e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  48.3 
 
 		 425 aa  322  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  46.43 
 
 		 431 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  50.9 
 
 		 459 aa  321  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  49.15 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  47.09 
 
 		 425 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  44.67 
 
 		 451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  49.11 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  45.61 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  44.74 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  44.87 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  44.87 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  44.87 
 
 		 431 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.12 
 
 		 436 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12670  dihydroorotase  47.9 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0696106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.26 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  44.66 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.49 
 
 		 434 aa  276  8e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.75 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.21 
 
 		 430 aa  266  7e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.34 
 
 		 436 aa  263  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  38.1 
 
 		 431 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.36 
 
 		 430 aa  259  7e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.23 
 
 		 429 aa  256  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.68 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  39.02 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.64 
 
 		 425 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.12 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.21 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  39.58 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  37.53 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  38.4 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  43.12 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.12 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.58 
 
 		 426 aa  247  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.6 
 
 		 473 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.45 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.32 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.27 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.96 
 
 		 430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  38.36 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  37.86 
 
 		 422 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  39.15 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.69 
 
 		 427 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  38.1 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  38.1 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.12 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  37.5 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  36.87 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.19 
 
 		 429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  39 
 
 		 425 aa  236  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.86 
 
 		 431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0502  dihydroorotase  42.63 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  41.01 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.79 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.03 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1306  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.01 
 
 		 431 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.2 
 
 		 434 aa  232  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.75 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  36.01 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0463  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.46 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0936737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  36.39 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  33.08 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  37.63 
 
 		 431 aa  229  9e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  37.73 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  37.2 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.43 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.34 
 
 		 425 aa  227  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1426  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.2 
 
 		 426 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.56 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.69767 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  38.36 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  38.36 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  38.36 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  37.83 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  38.1 
 
 		 428 aa  223  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  38.1 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.05 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  38.1 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  38.1 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  37.83 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>