23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4526 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4526  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  448  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  94.81 
 
 		 1509 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  88.06 
 
 		 1488 aa  215  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  48.95 
 
 		 1291 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  44.51 
 
 		 1465 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4223  hypothetical protein  40.52 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5662  hypothetical protein  37.12 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32850  hypothetical protein  37.93 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5659  hypothetical protein  34.23 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.74039  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1045  hypothetical protein  39.82 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.285314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14020  hypothetical protein  35.94 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  34.55 
 
 		 2144 aa  75.1  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0877  rhs protein  34.01 
 
 		 366 aa  68.6  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000054215  normal  0.085728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0537  hypothetical protein  32.35 
 
 		 594 aa  68.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000179948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2682  hypothetical protein  35.64 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.827753  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6275  hypothetical protein  39.36 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6456  hypothetical protein  41.03 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2528  hypothetical protein  36.69 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3198  hypothetical protein  31.88 
 
 		 284 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164759  normal  0.337288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4140  hypothetical protein  38.95 
 
 		 287 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3082  hypothetical protein  27.2 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03850  hypothetical protein  31.03 
 
 		 382 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.756618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2813  hypothetical protein  26.85 
 
 		 597 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>