More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4437 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4437  ABC-3 protein  100 
 
 		 294 aa  551  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  70.07 
 
 		 291 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  66.89 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3369  ABC-3 protein  69.66 
 
 		 289 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31310  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  74.91 
 
 		 291 aa  321  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  64.71 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  66.04 
 
 		 276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  68.08 
 
 		 295 aa  305  4.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  61.62 
 
 		 303 aa  296  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  53.85 
 
 		 294 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  55.19 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  54.95 
 
 		 285 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  51.28 
 
 		 290 aa  268  7e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  54.24 
 
 		 289 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  51.28 
 
 		 290 aa  265  5e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  52.38 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  54.81 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  51.89 
 
 		 285 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  51.89 
 
 		 285 aa  258  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  51.52 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  49.23 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  49.23 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  49.23 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  47.92 
 
 		 278 aa  246  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  45.71 
 
 		 294 aa  245  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  45.71 
 
 		 294 aa  245  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  45.04 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  47.7 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  45.04 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  45.04 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  50 
 
 		 275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  45.04 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  45.04 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  47.99 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  44.56 
 
 		 286 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  45.36 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  49.1 
 
 		 290 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  44.6 
 
 		 285 aa  241  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  45.52 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  45.19 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  47.57 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  45.15 
 
 		 286 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  45.15 
 
 		 287 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  50.7 
 
 		 312 aa  238  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  45.23 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  46.88 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  47.78 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  47.54 
 
 		 291 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  47.01 
 
 		 299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  45.39 
 
 		 286 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  43.75 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  44.32 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  42.86 
 
 		 285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  44.04 
 
 		 285 aa  232  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  44.79 
 
 		 296 aa  232  7.000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  42.7 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  50.52 
 
 		 306 aa  228  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  45.05 
 
 		 286 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  43.06 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  44.32 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  44.32 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  40.07 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 		 288 aa  222  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  42.45 
 
 		 280 aa  221  8e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  46.59 
 
 		 282 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  41.91 
 
 		 281 aa  218  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  46.21 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  46.21 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  46.21 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  41.13 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  49.04 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  46.21 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  39.86 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0299  ABC-3 protein  52.63 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0103187  normal  0.0511168 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  40.07 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  40.07 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  42.54 
 
 		 286 aa  212  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  45.28 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  44.03 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  43.46 
 
 		 279 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  43.68 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  41.92 
 
 		 285 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  43.08 
 
 		 292 aa  205  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  39.64 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  41.54 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  39.64 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  37.41 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  44.84 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  38.46 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  38.46 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  44.29 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  46.56 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  37.45 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  38.4 
 
 		 280 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  38.87 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  45.88 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.96 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0726  AfeD  41.44 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  40.56 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  45.88 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>