More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3903 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3903  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
314 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4637  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  73.87 
 
 
309 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2209  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  68.88 
 
 
331 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2213  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.84 
 
 
310 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  70.79 
 
 
314 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.632176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6510  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.45 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.267083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.41 
 
 
311 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1183  alcohol dehydrogenase  56.73 
 
 
314 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.300688  normal  0.0513369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3931  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.05 
 
 
301 aa  266  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198991  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  47.42 
 
 
584 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1526  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  44.76 
 
 
313 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.97459 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  38.51 
 
 
308 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3737  alcohol dehydrogenase  41.34 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1023  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2242  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.19 
 
 
314 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
312 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.54 
 
 
308 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.28 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  40.19 
 
 
314 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  33.97 
 
 
313 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  38.85 
 
 
321 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0078  putative Zinc-binding dehydrogenase  37.94 
 
 
317 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212844  decreased coverage  0.000689131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0832  putative oxidoreductase  39.37 
 
 
323 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1237  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.14 
 
 
308 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.82 
 
 
307 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 
320 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0422  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.3 
 
 
334 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0483327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 
307 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
326 aa  155  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.71 
 
 
308 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4293  NADPH:quinone reductase  39.81 
 
 
308 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213277  normal  0.0250565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.85 
 
 
329 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05420  Quinone oxidoreductase, putative  33.33 
 
 
358 aa  151  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.05 
 
 
307 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3524  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.47 
 
 
323 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.166573  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
308 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
339 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.42 
 
 
319 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  35.6 
 
 
305 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.53 
 
 
311 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4348  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.97 
 
 
313 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.65 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.71 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  36.64 
 
 
339 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2613  alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 
316 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 
325 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1050  alcohol dehydrogenase  37.55 
 
 
320 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.93 
 
 
333 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.87 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.82 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
333 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.99 
 
 
310 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
337 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.33 
 
 
314 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1998  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.68 
 
 
318 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.751932  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  33.66 
 
 
304 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
326 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2444  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.62 
 
 
312 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1679  alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 
318 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.33 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.34 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1584  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  32.59 
 
 
310 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
322 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5628  alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 
308 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6236  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.13 
 
 
326 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547714  normal  0.621953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.31 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  38.12 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8506  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  35.48 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.995989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.12 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.83 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
339 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2447  alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 
331 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.65 
 
 
317 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.69 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.56 
 
 
314 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3480  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.19 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  normal  0.315176 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.69 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  40.09 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2124  alcohol dehydrogenase  40.87 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185459  normal  0.116252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.48 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  37.69 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  40.09 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  34.85 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5695  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.22 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.08 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  39.91 
 
 
331 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
322 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.74 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  39.44 
 
 
331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3826  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.39 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141616  normal  0.0906959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4019  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.86 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.209092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2770  oxidoreductase, zinc-binding  31.43 
 
 
308 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000066091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
339 aa  129  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1020  quinone oxidoreductase  30.89 
 
 
315 aa  129  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.740068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.44 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.37 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4859  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.81 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939315  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.22 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2309  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.27 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>