24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2949 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2949  phage tail protein  100 
 
 		 191 aa  367  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4393  phage tail protein  42.05 
 
 		 179 aa  128  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1910  phage tail protein  37.14 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.162255  decreased coverage  0.000215371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3826  phage tail protein  38.29 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713673  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5380  phage tail protein  44.91 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.885071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2270  phage tail protein  41.78 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111092  hitchhiker  0.000515874 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0764  phage tail protein  32.64 
 
 		 727 aa  88.6  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.555023  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  25.47 
 
 		 346 aa  71.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  27.16 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1745  phage tail protein  33.33 
 
 		 404 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4353  hypothetical protein  29.73 
 
 		 696 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.218725  normal  0.229302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26620  phage tail protein  32.12 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.691503 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  30.69 
 
 		 747 aa  58.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1949  phage tail protein  38 
 
 		 676 aa  58.2  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0922  phage tail protein  26.26 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.153076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3609  phage tail protein  33 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1138  phage tail protein  25.99 
 
 		 339 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1514  phage tail protein  28.57 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  33.98 
 
 		 630 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1048  phage tail protein  31.62 
 
 		 263 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1416  phage tail protein  34.38 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0763  tail protein I  29.41 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4380  phage tail protein I  35.14 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.152838  hitchhiker  0.000126962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3047  phage tail protein  28.97 
 
 		 949 aa  41.2  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000382276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>