30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2332 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1525  PepSY-associated TM helix domain protein  98.65 
 
 		 517 aa  999    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2332  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 517 aa  1012    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4739  hypothetical protein  65.01 
 
 		 524 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3656  hypothetical protein  61.01 
 
 		 510 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00652624  normal  0.297307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0536  hypothetical protein  48.49 
 
 		 492 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05650  hypothetical protein  49.3 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3331  hypothetical protein  47.34 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.525329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2117  PepSY-associated TM helix domain protein  42.57 
 
 		 519 aa  359  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0908  PepSY-associated TM helix domain protein  40.99 
 
 		 499 aa  303  5.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.957301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0101  PepSY-associated TM helix  38.57 
 
 		 482 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0410  PepSY-associated TM helix domain protein  38.49 
 
 		 481 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0701  PepSY-associated TM helix  38.37 
 
 		 482 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0059  hypothetical protein  35.74 
 
 		 501 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0228  PepSY-associated TM helix domain protein  39 
 
 		 481 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1406  PepSY-associated TM helix domain protein  40.2 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.798402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0832  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.73 
 
 		 475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0860  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.57 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 475 aa  220  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3132  PepSY-associated TM helix domain protein  30.44 
 
 		 510 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.785962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3461  putative membrane/exported protein of unknown function  35.7 
 
 		 484 aa  200  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4221  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.09 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0103  hypothetical protein  44.12 
 
 		 78 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2357  PepSY-associated TM helix  32.98 
 
 		 238 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2411  hypothetical protein  52.63 
 
 		 70 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3463  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.86 
 
 		 236 aa  48.5  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3440  PepSY-associated TM helix domain protein  26.9 
 
 		 258 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0853  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.89 
 
 		 258 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0204  hypothetical protein  24.6 
 
 		 251 aa  45.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3708  hypothetical protein  24.9 
 
 		 476 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3634  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.89 
 
 		 260 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>