187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2053 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2053  carbohydrate kinase  100 
 
 
182 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402003  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  98.9 
 
 
182 aa  361  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.616409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2797  gluconate kinase  66.67 
 
 
209 aa  227  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.654483  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3761  carbohydrate kinase  70.19 
 
 
195 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117774  decreased coverage  0.00501521 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2346  carbohydrate kinase  54.44 
 
 
179 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1235  carbohydrate kinase  55.56 
 
 
189 aa  167  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2785  carbohydrate kinase  54.44 
 
 
179 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3416  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  53.85 
 
 
179 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0373306  normal  0.327266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2524  carbohydrate kinase  53.25 
 
 
179 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3337  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  52.38 
 
 
175 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00678717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2569  carbohydrate kinase  51.55 
 
 
373 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00777638  hitchhiker  0.0000000380765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3028  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  52 
 
 
196 aa  157  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3564  gluconokinase  53.09 
 
 
162 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00350968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0316  carbohydrate kinase  48.21 
 
 
174 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27310  gluconokinase  51.48 
 
 
175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2939  gluconokinase  52.02 
 
 
173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5548  carbohydrate kinase  48.8 
 
 
180 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34640  gluconokinase  51.45 
 
 
173 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.425531  normal  0.105648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  51.9 
 
 
167 aa  151  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22480  gluconokinase  48.52 
 
 
174 aa  148  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0327  carbohydrate kinase  53.29 
 
 
167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4336  gluconate kinase  50.6 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4531  carbohydrate kinase  49.69 
 
 
178 aa  144  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0956  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  49.07 
 
 
189 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0046  carbohydrate kinase  50 
 
 
169 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.324095 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3755  carbohydrate kinase  46.3 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0427  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.34 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0926  gluconate kinase  48.8 
 
 
202 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1575  carbohydrate kinase  46.2 
 
 
178 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.157856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1801  thermosensitive gluconokinase  46.2 
 
 
178 aa  136  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.688774  normal  0.112743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  47.47 
 
 
184 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6413  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.18 
 
 
185 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00235044  normal  0.475795 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2665  thermoresistant gluconokinase  41.72 
 
 
171 aa  134  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1469  thermosensitive gluconokinase  45.57 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3770  carbohydrate kinase  48.73 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.77 
 
 
759 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0216  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.51 
 
 
172 aa  131  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4512  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  48.97 
 
 
185 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0395  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.39 
 
 
179 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0625  carbohydrate kinase  43.83 
 
 
166 aa  130  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.207561  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2936  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  43.75 
 
 
177 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.300006 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0379  gluconate kinase  39.63 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.29 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4788  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  44.38 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0840  gluconokinase  43.75 
 
 
181 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  46.36 
 
 
779 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3252  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.25 
 
 
208 aa  128  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.507314  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00513  gluconate kinase  44 
 
 
173 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001959  gluconokinase  43.45 
 
 
174 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0441  thermoresistant gluconokinase (gluconate kinase 2) protein  41.21 
 
 
169 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.652705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2408  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.949742  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5034  gluconokinase  44.65 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0666  thermosensitive gluconokinase  38.12 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.337955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0595  carbohydrate kinase  50.33 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2769  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.18 
 
 
175 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3976  Gluconokinase  47.44 
 
 
237 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681946  normal  0.192181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4020  thermoresistant gluconokinase  42.5 
 
 
167 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4107  thermoresistant gluconokinase  42.5 
 
 
167 aa  124  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0136  carbohydrate kinase  42.5 
 
 
167 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3978  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40.96 
 
 
186 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2645  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  39.24 
 
 
172 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4056  carbohydrate kinase  40.48 
 
 
191 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0332  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  40 
 
 
169 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2577  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  33.97 
 
 
161 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3529  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  33.97 
 
 
161 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4087  carbohydrate kinase  40.96 
 
 
191 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4174  carbohydrate kinase  40.96 
 
 
191 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1226  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  43.87 
 
 
178 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5328  gluconate kinase  44.51 
 
 
171 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5417  gluconate kinase  44.51 
 
 
171 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5707  gluconate kinase  44.51 
 
 
171 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.787187  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0983  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.77 
 
 
165 aa  120  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0150853  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4571  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.34 
 
 
163 aa  120  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4650  gluconate kinase 1  40.96 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.648284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0317  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  38.79 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.638747  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1888  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  42.68 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0855471  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1046  gluconate kinase  44.59 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000585509  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5299  carbohydrate kinase thermoresistant glucokinase family  42.68 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0770  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.77 
 
 
159 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3742  gluconate kinase 1  38.65 
 
 
186 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0592  gluconate kinase  42.41 
 
 
165 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2356  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  41.25 
 
 
182 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.63212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6828  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45.93 
 
 
207 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0876  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  45 
 
 
183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.868196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4159  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  46.01 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134532  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2932  carbohydrate kinase  49.63 
 
 
167 aa  118  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2932  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family protein  38.36 
 
 
174 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.716161  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  42.26 
 
 
175 aa  118  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2577  carbohydrate kinase  40.76 
 
 
164 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313966 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04134  D-gluconate kinase, thermosensitive  37.57 
 
 
187 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3729  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  37.57 
 
 
187 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  40.99 
 
 
429 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04098  hypothetical protein  37.57 
 
 
187 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9123  gluconokinase  41.94 
 
 
171 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177068  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3845  gluconate kinase 1  38.92 
 
 
175 aa  117  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.518112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03288  gluconate kinase 2  37.95 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.609575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03241  hypothetical protein  37.95 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3720  gluconate kinase 1  38.55 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5911  carbohydrate kinase  42.95 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4497  gluconate kinase 1  41.76 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0404487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>