More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0578 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 518 aa  989    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  46.37 
 
 		 412 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  47.78 
 
 		 410 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  44.42 
 
 		 407 aa  364  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  36.13 
 
 		 407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  44.02 
 
 		 420 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  44.87 
 
 		 369 aa  317  4e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  41.49 
 
 		 413 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 		 443 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  40.57 
 
 		 407 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  40.57 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  39.16 
 
 		 415 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  42.53 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  40.28 
 
 		 407 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  37.83 
 
 		 455 aa  276  8e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  39.95 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  37.12 
 
 		 453 aa  270  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  43.02 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  38 
 
 		 411 aa  260  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 		 406 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  36.34 
 
 		 402 aa  256  9e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  35.02 
 
 		 423 aa  254  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  40.36 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  38.03 
 
 		 408 aa  243  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  35.32 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 		 428 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 		 402 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  38 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 		 403 aa  226  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 		 432 aa  223  8e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 		 406 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 		 412 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 		 417 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  38.29 
 
 		 425 aa  209  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  38.67 
 
 		 390 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  30.95 
 
 		 401 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  30.28 
 
 		 401 aa  173  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  24.51 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  41.8 
 
 		 188 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  41.8 
 
 		 188 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.66 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.3 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.7 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.05 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.05 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.05 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 395 aa  66.6  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  22.03 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.79 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  21.85 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.56 
 
 		 365 aa  63.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 		 385 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.97 
 
 		 384 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  22.12 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  29.15 
 
 		 723 aa  62.4  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 		 371 aa  62  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  30.73 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  21.52 
 
 		 745 aa  60.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.43 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 389 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>