24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3403 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  864    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  95.3 
 
 
486 aa  719    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  95.75 
 
 
486 aa  713    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  59.4 
 
 
509 aa  465  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  49.45 
 
 
537 aa  414  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  46.67 
 
 
416 aa  342  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  46.67 
 
 
416 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  46.35 
 
 
430 aa  325  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  43.51 
 
 
420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  47.07 
 
 
419 aa  309  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  47.58 
 
 
418 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  44.5 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  45.35 
 
 
419 aa  305  8.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  49.76 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  48.07 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  46.25 
 
 
416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  46.65 
 
 
420 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  45.19 
 
 
416 aa  299  8e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  44.44 
 
 
419 aa  291  2e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  44.82 
 
 
419 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  41.86 
 
 
420 aa  286  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  42.92 
 
 
420 aa  285  8e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  47.28 
 
 
425 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  28.51 
 
 
450 aa  221  3e-56  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>