51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0498 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0498  carbohydrate kinase, PfkB  100 
 
 
285 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0531  PfkB domain protein  94.39 
 
 
285 aa  487  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0526  PfkB domain protein  93.33 
 
 
285 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387077  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2912  ribokinase-like domain-containing protein  71.84 
 
 
290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.140234 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11501  putative pfkB family carbohydrate kinase  34.68 
 
 
289 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.605527  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0709  putative pfkB family carbohydrate kinase  38.4 
 
 
280 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.19808  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1055  PfkB family carbohydrate kinase  33.73 
 
 
289 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.18758  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15431  putative pfkB family carbohydrate kinase  38.4 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.345352  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1746  pfkB family carbohydrate kinase  41.2 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11491  putative pfkB family carbohydrate kinase  33.87 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0717159  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11351  putative pfkB family carbohydrate kinase  30.15 
 
 
289 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11481  putative pfkB family carbohydrate kinase  36.13 
 
 
280 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.036183  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12381  putative pfkB family carbohydrate kinase  39.78 
 
 
283 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1813  pfkB family carbohydrate kinase  38.13 
 
 
309 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1085  PfkB domain protein  42.75 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  30.95 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.29 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  33.46 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  29.81 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
284 aa  55.8  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  32.72 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4799  ribokinase-like domain-containing protein  24.89 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319508 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0279  ribokinase-like domain-containing protein  27.62 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4412  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.42 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.209851 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0275  PfkB domain protein  26.67 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0278  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.365265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0271  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 
283 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  28.67 
 
 
310 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  34.29 
 
 
311 aa  49.3  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12463  ribokinase rbsK  31.05 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  24.3 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  24.3 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  36.13 
 
 
309 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  29.86 
 
 
304 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  29.29 
 
 
312 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0078  ribokinase-like domain-containing protein  27.4 
 
 
286 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.18 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  25.59 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  24.54 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0624  ribokinase-like domain-containing protein  27.02 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  28.7 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  34.45 
 
 
309 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  32.71 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  25.26 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0077  ribokinase-like domain-containing protein  26.19 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  26.87 
 
 
302 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  26.98 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  31.82 
 
 
308 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>