47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1035 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1035  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 57 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.949319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0768  Flp/Fap pilin component  53.57 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2323  Flp/Fap pilin component  51.85 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2110  Flp/Fap pilin component  57.45 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1915  Flp/Fap pilin component  54 
 
 		 52 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00503365  hitchhiker  0.00635938 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 52 aa  51.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3202  hypothetical protein  41.51 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  42.86 
 
 		 58 aa  50.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  47.17 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1121  Flp/Fap pilin component  48 
 
 		 52 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.932895 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6287  Flp/Fap pilin component  46.94 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0789  Flp/Fap pilin component  47.17 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0222  component of type 4 pilus pilin subunit protein  38.18 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0605  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.531331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2109  hypothetical protein  44.68 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5991  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.848765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1059  hypothetical protein  43.4 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1794  Flp/Fap pilin component  42.59 
 
 		 54 aa  47.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.55004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2152  hypothetical protein  46 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4196  Flp/Fap pilin component  41.51 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2639  Flp/Fap pilin component  42 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  34.55 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1171  Flp/Fap pilin component  39.58 
 
 		 56 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000265809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3792  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 54 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1026  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2489  Flp/Fap pilin component  46.67 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1839  Flp/Fap pilin component  38.18 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2919  Flp/Fap pilin component  35.85 
 
 		 59 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0798  Flp/Fap pilin component  44.44 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  41.67 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2831  Flp/Fap pilin component  32.08 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5868  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.229195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5504  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458126  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6378  Flp/Fap pilin component  45.65 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.43993 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0652  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  37.04 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  35.85 
 
 		 54 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1406  Flp/Fap pilin component  35.85 
 
 		 54 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0230  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 54 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  41.3 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2920  Flp/Fap pilin component  40.35 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.745426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  33.93 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2363  Flp/Fap pilin component  37.25 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4095  Flp/Fap pilin component  37.04 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1649  Flp/Fap pilin component  33.96 
 
 		 59 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132405  normal  0.784096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>