50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3436 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  53.9 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  55.32 
 
 		 162 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  44.53 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  40.13 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2596  hypothetical protein  55.43 
 
 		 95 aa  108  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292698  normal  0.0948228 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6546  hypothetical protein  47.13 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  29.24 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5296  hypothetical protein  43.33 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5563  hypothetical protein  43.33 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3876  hypothetical protein  51.43 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  30.27 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  32.34 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  32.28 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  32.28 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  31.5 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  31.54 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  33.85 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  28.12 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  30.67 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  39.8 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1181  hypothetical protein  38.16 
 
 		 85 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.120079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  31.5 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  28.68 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  32.53 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  28.69 
 
 		 127 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  29.92 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  30.3 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  36.73 
 
 		 136 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  31.25 
 
 		 136 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  27.07 
 
 		 146 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  32.52 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  27.97 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  28.23 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  27.91 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  20.31 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  27.78 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  29.03 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  31 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  29.23 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  42.22 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  28.23 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  31 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  35.8 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  31 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  27.91 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  33.75 
 
 		 145 aa  42  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  27.89 
 
 		 154 aa  41.6  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  20.16 
 
 		 150 aa  41.6  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  29.07 
 
 		 141 aa  41.2  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>