165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2084 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2084  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1045    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.800831  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  30.83 
 
 		 537 aa  216  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  29.65 
 
 		 546 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  29.55 
 
 		 556 aa  203  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  28.57 
 
 		 558 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  29.5 
 
 		 561 aa  200  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  28.21 
 
 		 546 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  27.85 
 
 		 555 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  28.99 
 
 		 559 aa  195  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  26.95 
 
 		 543 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  26.82 
 
 		 572 aa  194  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  26.49 
 
 		 545 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  27.37 
 
 		 552 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  27.34 
 
 		 552 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  28.92 
 
 		 539 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  27.31 
 
 		 537 aa  189  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  29.07 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  29.12 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  26.28 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  25.82 
 
 		 546 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  28.07 
 
 		 539 aa  186  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  25.56 
 
 		 539 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  25.56 
 
 		 539 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  25.65 
 
 		 546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  27.98 
 
 		 547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  25.9 
 
 		 539 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  25.65 
 
 		 546 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  25.33 
 
 		 551 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  25.33 
 
 		 551 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  25.33 
 
 		 551 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  25.66 
 
 		 539 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  25.66 
 
 		 539 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  26.8 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  25.66 
 
 		 539 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  25.33 
 
 		 539 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  25.64 
 
 		 544 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  25.78 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  25.14 
 
 		 553 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  25.14 
 
 		 551 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  25.14 
 
 		 551 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  25.14 
 
 		 551 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  26.56 
 
 		 547 aa  179  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  29.49 
 
 		 531 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  26.43 
 
 		 547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  26.45 
 
 		 533 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  27.32 
 
 		 508 aa  173  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  27 
 
 		 569 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  24.11 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  25.57 
 
 		 556 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  25.92 
 
 		 548 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  26.86 
 
 		 550 aa  170  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  25.99 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  25.55 
 
 		 548 aa  169  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  25.77 
 
 		 546 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  25.19 
 
 		 547 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  25.59 
 
 		 546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  25.37 
 
 		 550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  24.21 
 
 		 547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  25.59 
 
 		 546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  25.59 
 
 		 546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1668  mce family protein  29.4 
 
 		 883 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00393452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  25.37 
 
 		 550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  25.37 
 
 		 550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1779  hypothetical protein  29.4 
 
 		 876 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.284568  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  25.59 
 
 		 546 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2667  hypothetical protein  29.4 
 
 		 883 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.209056  normal  0.0159074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  24.25 
 
 		 547 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  24.91 
 
 		 559 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1539  hypothetical protein  26.79 
 
 		 880 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123668  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  24.45 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2127  hypothetical protein  26.65 
 
 		 874 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.182748  normal  0.142819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2008  hypothetical protein  26.43 
 
 		 547 aa  160  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  26.46 
 
 		 545 aa  160  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  26.28 
 
 		 546 aa  160  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3077  putative paraquat-inducible protein B  22.4 
 
 		 580 aa  158  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  25.82 
 
 		 546 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  25.82 
 
 		 546 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2391  hypothetical protein  27.59 
 
 		 545 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931506  normal  0.945303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  25.82 
 
 		 546 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  25.82 
 
 		 546 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  25.82 
 
 		 546 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  25.82 
 
 		 546 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  25.82 
 
 		 546 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  25.82 
 
 		 546 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02851  hypothetical protein  22.18 
 
 		 548 aa  156  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1988  mce-related protein  27.67 
 
 		 879 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  24.72 
 
 		 559 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2050  mce-related protein  27.67 
 
 		 877 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1992  mce-related protein  27.67 
 
 		 879 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  24.68 
 
 		 550 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1282  mce-related protein  27.67 
 
 		 877 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000164876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2489  virulence factor MCE-like protein  27.7 
 
 		 874 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.336956  normal  0.349105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1466  mce-related protein  27.38 
 
 		 877 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.62714  normal  0.15186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1353  mce-related protein  27.86 
 
 		 879 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0226456  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2692  hypothetical protein  29.5 
 
 		 688 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1808  Mammalian cell entry related domain protein  27.58 
 
 		 877 aa  153  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01793  hypothetical protein  27.58 
 
 		 877 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1798  hypothetical protein  27.58 
 
 		 877 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604041  normal  0.0674591 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2567  mce-related protein  27.58 
 
 		 879 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2063  mce-related protein  27.58 
 
 		 879 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>