38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1184 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1184  TonB family protein  100 
 
 		 249 aa  463  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  57.14 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  57.14 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1175  hypothetical protein  50.82 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0296  TonB family protein  37.98 
 
 		 192 aa  67  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  28.4 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  28.4 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0770  TonB family protein  33.33 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0913  TonB family protein  33.33 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  32.47 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  39.08 
 
 		 451 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2268  TonB family protein  33.04 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1915  TonB family protein  33.04 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  35.56 
 
 		 285 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  28.04 
 
 		 219 aa  52.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  34.02 
 
 		 2179 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  25.29 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0748  TonB family protein  39.02 
 
 		 129 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.491614  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  43.14 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  29.65 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  27.5 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1218 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  37.84 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  27.11 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  32.56 
 
 		 308 aa  45.4  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  27.78 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  31.82 
 
 		 317 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  40 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  31.16 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  27.75 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  38.24 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2612  hypothetical protein  34.07 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3002  TonB family protein  34.07 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  31.82 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  39.29 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  31.03 
 
 		 237 aa  42  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  27.42 
 
 		 324 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>