More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3868 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
442 aa  905    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  52.27 
 
 
433 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  50.35 
 
 
429 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
433 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  49.64 
 
 
444 aa  441  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  48.45 
 
 
435 aa  435  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  48.45 
 
 
434 aa  435  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  49.4 
 
 
430 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  49.29 
 
 
427 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  49.17 
 
 
447 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  47.73 
 
 
431 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  48.45 
 
 
430 aa  435  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 
449 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  49.52 
 
 
447 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 
432 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  49.4 
 
 
432 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  48.14 
 
 
433 aa  426  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  47.96 
 
 
427 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  47.49 
 
 
434 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 
444 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
434 aa  425  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  47.29 
 
 
428 aa  428  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  46.54 
 
 
434 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 
427 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  48.22 
 
 
447 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  48.69 
 
 
437 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  47.29 
 
 
428 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  46.65 
 
 
430 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  47.02 
 
 
429 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  48.8 
 
 
430 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 
431 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  47.38 
 
 
427 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  47.85 
 
 
427 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2691  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 
432 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  45.71 
 
 
434 aa  419  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  46.46 
 
 
427 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  47.54 
 
 
428 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1265  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 
432 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0163864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 
427 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  48.12 
 
 
451 aa  418  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  47.49 
 
 
428 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  47.97 
 
 
432 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  47.49 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  49.05 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  48.57 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2598  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 
432 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0051551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  47.26 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  47.97 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  47.87 
 
 
430 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 
431 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  47.43 
 
 
430 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  48.58 
 
 
430 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  46.78 
 
 
430 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 
430 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  47.37 
 
 
427 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  47.67 
 
 
428 aa  410  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  47.29 
 
 
427 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  47.87 
 
 
427 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  47.37 
 
 
428 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  46.54 
 
 
430 aa  411  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  46.78 
 
 
429 aa  411  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  47.49 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  47.73 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  47.73 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  47.29 
 
 
428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  49.16 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  47.13 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  47.26 
 
 
429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2532  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5102  adenylosuccinate synthetase  48.5 
 
 
448 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  46.43 
 
 
427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  47.73 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  47.02 
 
 
431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 
434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1712  adenylosuccinate synthetase  48.27 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12828  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  45.58 
 
 
426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  47.06 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  45.24 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6278  adenylosuccinate synthetase  48.04 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0990  adenylosuccinate synthetase  47.49 
 
 
429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1473  adenylosuccinate synthetase  48.04 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209737  normal  0.290596 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  47.73 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  48.02 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  47.32 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  46.3 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  47.32 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1739  adenylosuccinate synthetase  48.27 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1825  adenylosuccinate synthetase  48.04 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.260214  normal  0.42401 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1801  adenylosuccinate synthetase  48.04 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  46.19 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  47.02 
 
 
431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  47.02 
 
 
431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 
432 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1409  adenylosuccinate synthetase  47.34 
 
 
448 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000087591 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  45.43 
 
 
435 aa  405  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1889  adenylosuccinate synthetase  49.28 
 
 
431 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  46.06 
 
 
446 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 
424 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>