22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1218 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1218  TonB-like protein  100 
 
 		 233 aa  475  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0834561  normal  0.166487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  34.52 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  39.02 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  35.44 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  35.44 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  31.03 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  30.43 
 
 		 134 aa  52.4  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  33.75 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  32.1 
 
 		 582 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  30.59 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  35 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  31.33 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  28.89 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  26.83 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  31.11 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.91 
 
 		 459 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  27.38 
 
 		 150 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  32.5 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  33.75 
 
 		 288 aa  42.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  36.49 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  33.71 
 
 		 275 aa  42  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  32.56 
 
 		 283 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>