29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0818 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  100 
 
 
735 aa  1506    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  29.34 
 
 
735 aa  260  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  29.72 
 
 
785 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  34.8 
 
 
824 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  35.79 
 
 
892 aa  217  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  26.94 
 
 
725 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  26.36 
 
 
741 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  30.79 
 
 
841 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  30.19 
 
 
877 aa  172  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  29.59 
 
 
881 aa  167  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  29.74 
 
 
936 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  31.91 
 
 
868 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  33.43 
 
 
873 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  33.06 
 
 
872 aa  157  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  33.15 
 
 
873 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  30.16 
 
 
808 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  28.67 
 
 
778 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  24.56 
 
 
788 aa  124  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  26.15 
 
 
793 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  24.3 
 
 
790 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  27.64 
 
 
810 aa  117  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  28.15 
 
 
799 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  28.15 
 
 
799 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  26.04 
 
 
799 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  25.15 
 
 
803 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  26.72 
 
 
761 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  25.11 
 
 
379 aa  51.2  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2035  hypothetical protein  25 
 
 
356 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2434  hypothetical protein  23.29 
 
 
245 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>