More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2124 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2124  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  501  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  44.5 
 
 
226 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.34 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  48.82 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  42.23 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  38.43 
 
 
244 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  38.91 
 
 
268 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  33.94 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  38.19 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  39.25 
 
 
363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  37.69 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  40.3 
 
 
198 aa  108  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.33 
 
 
201 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.4 
 
 
239 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  43.43 
 
 
207 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  36.62 
 
 
256 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  33.75 
 
 
277 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  37.21 
 
 
259 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  30.56 
 
 
221 aa  102  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  39.36 
 
 
221 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  37.17 
 
 
213 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  39.11 
 
 
228 aa  99.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  34.4 
 
 
235 aa  99.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.05 
 
 
216 aa  99.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.38 
 
 
206 aa  99  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
219 aa  98.6  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  34.5 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.52 
 
 
194 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  34.08 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  34 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  36.55 
 
 
219 aa  96.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.41 
 
 
286 aa  96.3  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  34 
 
 
219 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  34 
 
 
219 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  34 
 
 
219 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  32.78 
 
 
220 aa  95.9  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  34.71 
 
 
206 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.87 
 
 
209 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  34.78 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  39.13 
 
 
235 aa  93.2  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  35.87 
 
 
219 aa  93.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  35.87 
 
 
219 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1453  hypothetical protein  32.28 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  35.84 
 
 
204 aa  92.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  35.33 
 
 
213 aa  92.4  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4407  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.92 
 
 
215 aa  92  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  38.96 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  34.85 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.96 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  33.33 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  34.85 
 
 
220 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  34.85 
 
 
220 aa  91.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  38.96 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  38.96 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  35.33 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  38.96 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  38.96 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  34.85 
 
 
220 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.4 
 
 
458 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  34.9 
 
 
220 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  37.85 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  32.69 
 
 
229 aa  90.5  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  34.97 
 
 
219 aa  89.7  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.03 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  35.83 
 
 
221 aa  89.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  35.33 
 
 
214 aa  88.6  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.68 
 
 
231 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  34.67 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  36.22 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.22 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  34.7 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  35.12 
 
 
202 aa  86.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  37.5 
 
 
202 aa  85.9  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  36.92 
 
 
216 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  33.82 
 
 
227 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  34.16 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  34.23 
 
 
201 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  34.67 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  36.88 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  35.48 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  35.23 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  33.04 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  33.86 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  40.94 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  35.76 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  33.04 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  33.04 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  38.83 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  33.16 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  34.9 
 
 
222 aa  82  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  31.19 
 
 
245 aa  82  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  36.36 
 
 
217 aa  82  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  33.01 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  34.78 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  34.78 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  35.18 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0210  hypothetical protein  35.03 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>