41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1981 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1981  putative integral membrane protein  100 
 
 		 272 aa  526  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  40.57 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  37.99 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  36.63 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  35.8 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  36.11 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  41.11 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  27.75 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  40.78 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  31.07 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  31.07 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  32.11 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  25.67 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  36.56 
 
 		 242 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 325 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  31.13 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  33.66 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  37.88 
 
 		 448 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  24.79 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  23.56 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  29.27 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  29.25 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  29.13 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3371  hypothetical protein  40.82 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  28.92 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  28.92 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  28.92 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  28.92 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  28.92 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  36.84 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4837  type II secretion system protein  41.24 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  28.92 
 
 		 331 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 262 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>