46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0022 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0038  tRNA-Ala  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0033  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397319  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0023  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0028  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0021  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  94.87 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0071  tRNA-Ala  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0013  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0697084  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  96.88 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  96.88 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1369  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0052  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000162603  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  86.79 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  86.79 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0054  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0016  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0016  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00032499  normal  0.0128172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0052  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0054  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000742572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0062  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749311  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0007    93.33 
 
 		 203 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0042  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0038  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0057  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0671141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>