20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0045 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  93.15 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0048  tRNA-Ala  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143033  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  86.36 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  86.36 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  89.8 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  84.85 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0007    84.85 
 
 		 203 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>