39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0041 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0013  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0013  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0809108  normal  0.295028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309299  tRNA-Thr  88.71 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0668617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0043  tRNA-Thr  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  90.2 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0054  tRNA-Ala  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0007    84.72 
 
 		 203 bp  56  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0043  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176927 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309355  tRNA-Thr  83.87 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.824908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309354  tRNA-Thr  83.87 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0010  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0013  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309157  tRNA-Thr  83.87 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309202  tRNA-Thr  83.87 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.083443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAThrVIMSS1309113  tRNA-Thr  83.87 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309082  tRNA-Thr  83.87 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.248116  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309081  tRNA-Thr  83.87 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0014  tRNA-Thr  83.87 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0041  tRNA-Thr  83.87 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>