20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0013 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0013  tRNA-Ala  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0809108  normal  0.295028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  87.1 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  89.58 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0035  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000289059  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0033  tRNA-Val  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0043  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>