34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0022 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 75 bp  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0048  tRNA-Ala  94.23 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143033  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  92.19 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  85.14 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0006  tRNA-Ala  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0009  tRNA-Ala  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0007    86.21 
 
 		 203 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0013  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0055  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000146939  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0045  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000186753  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  84.48 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  84.48 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0041  tRNA-Val  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.424139  normal  0.210105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>