33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_R0004 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0013  tRNA-Ala  97.22 
 
 		 72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0013  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0809108  normal  0.295028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 75 bp  119  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0043  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  86.3 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  88.24 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00032499  normal  0.0128172 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0054  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0007    83.33 
 
 		 203 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt07  tRNA-Thr  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0043  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0019  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0308223  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0010  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0021  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.571582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309299  tRNA-Thr  83.87 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0668617 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 99 bp  44.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>