27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0007 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0007    100 
 
 		 203 bp  402  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  100 
 
 		 1005 bp  232  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  93.68 
 
 		 1014 bp  141  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  97.22 
 
 		 72 bp  127  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0006  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.467617 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0054  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0052  tRNA-Ala  89.19 
 
 		 75 bp  83.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.707391 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  88.06 
 
 		 75 bp  69.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  81.25 
 
 		 1005 bp  56  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  82.61 
 
 		 1023 bp  56  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  84.85 
 
 		 72 bp  52  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  84.85 
 
 		 75 bp  52  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 72 bp  52  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  84.62 
 
 		 1014 bp  50.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  84.62 
 
 		 1014 bp  50.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  83.12 
 
 		 1014 bp  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0004  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0057  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0010  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>