128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4554 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4554  SmpA/OmlA domain-containing protein  100 
 
 
185 aa  377  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1069  SmpA/OmlA domain-containing protein  60.29 
 
 
199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6008  SmpA/OmlA domain-containing protein  62.7 
 
 
193 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3271  SmpA/OmlA domain protein  63.54 
 
 
183 aa  216  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3923  SmpA/OmlA domain-containing protein  62.98 
 
 
183 aa  214  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0754  SmpA/OmlA  57.47 
 
 
170 aa  201  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0407  SmpA/OmlA domain protein  63.43 
 
 
186 aa  177  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3790  SmpA/OmlA domain-containing protein  58.55 
 
 
204 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0222  small protein A (tmRNA-binding)-like protein  45.36 
 
 
183 aa  171  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4609  SmpA/OmlA  62.6 
 
 
170 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2575  SmpA/OmlA domain protein  37.86 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2985  SmpA/OmlA domain protein  37.8 
 
 
218 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  37.16 
 
 
219 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  46.04 
 
 
185 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  45.97 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0475  SmpA/OmlA domain-containing protein  38.33 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3456  outer membrane lipoprotein, putatitve  49.59 
 
 
251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1207  outer membrane lipoprotein, putatitve  49.57 
 
 
267 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2975  SmpA/OmlA  50.93 
 
 
258 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.977187  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  42.41 
 
 
242 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  48.18 
 
 
249 aa  121  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  48.72 
 
 
276 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  48.72 
 
 
279 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3419  SmpA/OmlA family lipoprotein  48.72 
 
 
263 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  48.72 
 
 
263 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2644  SmpA/OmlA family lipoprotein  48.72 
 
 
263 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  46.55 
 
 
273 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  48.31 
 
 
272 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  45.59 
 
 
228 aa  117  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  46.96 
 
 
268 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  46.96 
 
 
268 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  46.96 
 
 
268 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2592  SmpA/OmlA domain-containing protein  46.67 
 
 
297 aa  117  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3384  SmpA/OmlA domain protein  47.79 
 
 
276 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0572  putative outer membrane lipoprotein  46.02 
 
 
288 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  45.22 
 
 
265 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  45.22 
 
 
265 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  47.17 
 
 
135 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  33.56 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  35.37 
 
 
173 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  34.19 
 
 
281 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2622  small protein A  36.76 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  37.61 
 
 
233 aa  89.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63030  outer membrane lipoprotein OmlA precursor  33.1 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5485  outer membrane lipoprotein OmlA  33.1 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  37.72 
 
 
131 aa  89  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  43.75 
 
 
342 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  42.11 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.58 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0935  SmpA/OmlA  39.82 
 
 
160 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.970773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  31.33 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.89 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.84 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.84 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1517  outer membrane protein  40 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718257  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1460  SmpA/OmlA domain-containing protein  40 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  39.76 
 
 
171 aa  79  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  37.04 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01180  outer membrane protein  41.11 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407548  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2051  SmpA/OmlA domain protein  37.62 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0966  outer membrane lipoprotein  35.64 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1906  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.05 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1593  SmpA/OmlA domain protein  39.56 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3098  SmpA/OmlA  34.67 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1482  SmpA/OmlA domain-containing protein  38.67 
 
 
111 aa  67  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.57 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3968  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.86 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  30.56 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1406  SmpA/OmlA  38.75 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.12 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0457  SmpA/OmlA domain protein  37.5 
 
 
115 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0279  lipoprotein, SmpA/OmlA family  37.5 
 
 
115 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1310  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.26 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3049  SmpA/OmlA domain protein  30.26 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.331273  normal  0.468309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1301  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.26 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.84513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1337  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.26 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1523  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.8 
 
 
167 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512522  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2773  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.97 
 
 
174 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664934  normal  0.104565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2851  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.97 
 
 
174 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2949  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.97 
 
 
174 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1476  small protein A  33.33 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0986  SmpA/OmlA domain protein  34 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1410  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.08 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3366  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.62 
 
 
110 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0061494  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.97 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0437  hypothetical protein  27.62 
 
 
104 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0413  hypothetical protein  27.62 
 
 
104 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0290  SmpA/OmlA  28.45 
 
 
138 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0676323  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2385  small protein A  29.17 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.750326  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1271  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.04 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175523  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1242  SmpA/OmlA  34.29 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.834375  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0264  outer membrane lipoprotein OmlA  30.68 
 
 
138 aa  55.5  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.28381  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1605  Outer membrane lipoprotein OmlA  32.86 
 
 
148 aa  55.5  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.730668  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1391  outer membrane lipoprotein  27.27 
 
 
114 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000387468  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0227  small protein A  35.53 
 
 
128 aa  54.7  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1713  SmpA/OmlA  30.1 
 
 
118 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1886  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.87 
 
 
124 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0727  hypothetical protein  36.62 
 
 
111 aa  52  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.405452  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3687  hypothetical protein  31.63 
 
 
112 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0028904  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  32.04 
 
 
113 aa  52  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>