24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4450 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  815    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  72.6 
 
 
419 aa  547  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  68.58 
 
 
416 aa  534  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  74.88 
 
 
419 aa  534  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  69.64 
 
 
416 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  68.84 
 
 
416 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  72.35 
 
 
425 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  59.95 
 
 
418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  54.81 
 
 
416 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  55.01 
 
 
420 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  55.05 
 
 
416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  56.63 
 
 
430 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  55.37 
 
 
419 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  54.57 
 
 
419 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  58.03 
 
 
420 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  54.42 
 
 
419 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  51.72 
 
 
420 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  49.51 
 
 
420 aa  363  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  45.18 
 
 
509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  43.18 
 
 
537 aa  288  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  48.19 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  47.22 
 
 
486 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  47.22 
 
 
486 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  28.91 
 
 
450 aa  186  5e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>