24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3959 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  808    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  74.41 
 
 
419 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  69.55 
 
 
416 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  74.75 
 
 
419 aa  524  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  68.33 
 
 
416 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  71.09 
 
 
419 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  70.05 
 
 
416 aa  506  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  63.77 
 
 
418 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  57.76 
 
 
419 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  54.42 
 
 
420 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  55.76 
 
 
430 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  55.05 
 
 
416 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  55.21 
 
 
419 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  55.29 
 
 
416 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  60.24 
 
 
420 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  54.44 
 
 
419 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  52.98 
 
 
420 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  50.96 
 
 
420 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  46.12 
 
 
509 aa  317  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  42.11 
 
 
537 aa  290  4e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  47.57 
 
 
447 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  47.57 
 
 
486 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  46.84 
 
 
486 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  27.94 
 
 
450 aa  182  1e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>