28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3476 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3476  rhs-related protein  100 
 
 		 106 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.261412  normal  0.764471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  97.92 
 
 		 1586 aa  191  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  97.92 
 
 		 553 aa  191  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  40.62 
 
 		 1602 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  38.14 
 
 		 866 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  37.11 
 
 		 1400 aa  59.3  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  37.11 
 
 		 1385 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  41.94 
 
 		 1554 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  37.11 
 
 		 1411 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  37.11 
 
 		 561 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  37.11 
 
 		 1386 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  37.11 
 
 		 1140 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  37.11 
 
 		 1409 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  37.11 
 
 		 555 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  37.11 
 
 		 867 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  36.08 
 
 		 480 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  34.34 
 
 		 1229 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  36.26 
 
 		 1362 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1654 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  35.42 
 
 		 1410 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  34.95 
 
 		 1583 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  35.87 
 
 		 1348 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  33.65 
 
 		 1604 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  37.08 
 
 		 1531 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  32.29 
 
 		 1568 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  58.06 
 
 		 1446 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  32.29 
 
 		 924 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  46.51 
 
 		 1530 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>