More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0944 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3094  glucose-6-phosphate isomerase  62.98 
 
 
545 aa  648    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0675  glucose-6-phosphate isomerase  77.44 
 
 
538 aa  824    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1103  glucose-6-phosphate isomerase  70.19 
 
 
520 aa  711    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5674  glucose-6-phosphate isomerase  62.78 
 
 
540 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.26291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5598  glucose-6-phosphate isomerase  64.71 
 
 
520 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.885182  normal  0.434558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1127  glucose-6-phosphate isomerase  70.91 
 
 
522 aa  739    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0753  glucose-6-phosphate isomerase  71.73 
 
 
525 aa  759    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0697  glucose-6-phosphate isomerase  77.63 
 
 
538 aa  830    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000815409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3385  glucose-6-phosphate isomerase  63.34 
 
 
545 aa  657    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4222  glucose-6-phosphate isomerase  68.85 
 
 
944 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0944  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
532 aa  1077    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0655  glucose-6-phosphate isomerase  70.77 
 
 
521 aa  733    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0621546  decreased coverage  0.00285419 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  51.73 
 
 
548 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  50.18 
 
 
548 aa  528  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  53.26 
 
 
545 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  52.12 
 
 
548 aa  522  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 
547 aa  522  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  50.36 
 
 
549 aa  520  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  51.09 
 
 
541 aa  521  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  52.67 
 
 
549 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  52.67 
 
 
549 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  50.66 
 
 
560 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  52.51 
 
 
541 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  51.7 
 
 
549 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  52.04 
 
 
541 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1905  glucose-6-phosphate isomerase  51.34 
 
 
556 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1835  glucose-6-phosphate isomerase  52.12 
 
 
540 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  49.91 
 
 
559 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  51.3 
 
 
541 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  49.45 
 
 
562 aa  501  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  51.25 
 
 
556 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
548 aa  502  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2132  glucose-6-phosphate isomerase  52.4 
 
 
615 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  53.16 
 
 
541 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  51.02 
 
 
547 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1215  glucose-6-phosphate isomerase  52.04 
 
 
540 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1942  glucose-6-phosphate isomerase  52.04 
 
 
540 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1449  glucose-6-phosphate isomerase  52.04 
 
 
540 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.446361  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  53.25 
 
 
541 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2466  glucose-6-phosphate isomerase  52.04 
 
 
540 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  47.11 
 
 
548 aa  499  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3363  glucose-6-phosphate isomerase  52.04 
 
 
540 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  52.22 
 
 
540 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  51.43 
 
 
556 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  45.47 
 
 
567 aa  498  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2347  glucose-6-phosphate isomerase  52.04 
 
 
540 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  51.43 
 
 
556 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1914  glucose-6-phosphate isomerase  50.56 
 
 
540 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572285  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1019  glucose-6-phosphate isomerase  50.94 
 
 
540 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500907  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  48.2 
 
 
549 aa  498  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  49.16 
 
 
552 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2308  glucose-6-phosphate isomerase  51.67 
 
 
540 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764178  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  52.67 
 
 
547 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  49.28 
 
 
547 aa  495  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  51.52 
 
 
649 aa  498  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  51.68 
 
 
545 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  48.99 
 
 
552 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  47.94 
 
 
549 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  47.36 
 
 
550 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  51.96 
 
 
543 aa  495  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  47.3 
 
 
549 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  47.12 
 
 
549 aa  488  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  47.3 
 
 
549 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  49.73 
 
 
550 aa  490  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  47.58 
 
 
549 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2924  glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 
539 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  48.58 
 
 
531 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  47.3 
 
 
549 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  47.3 
 
 
549 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  47.3 
 
 
549 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  51.4 
 
 
543 aa  488  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  47.3 
 
 
549 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  47.3 
 
 
549 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  47.3 
 
 
549 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2539  Glucose-6-phosphate isomerase  50.46 
 
 
539 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  45.68 
 
 
549 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  46.81 
 
 
550 aa  487  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  48.91 
 
 
547 aa  488  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1649  glucose-6-phosphate isomerase  51.58 
 
 
542 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  46.81 
 
 
550 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2287  glucose-6-phosphate isomerase  50 
 
 
540 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384563  normal  0.236333 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  49.09 
 
 
551 aa  487  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  47.12 
 
 
548 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1357  glucose-6-phosphate isomerase  51.5 
 
 
540 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553854  normal  0.605631 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  47.12 
 
 
548 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  48.3 
 
 
550 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  47.12 
 
 
548 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  46.45 
 
 
550 aa  482  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  49.17 
 
 
546 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  45.37 
 
 
548 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  46.77 
 
 
549 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  46.95 
 
 
549 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  46.77 
 
 
549 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2589  Glucose-6-phosphate isomerase  50.09 
 
 
569 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0431757  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  46.95 
 
 
549 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  46.95 
 
 
549 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  45.74 
 
 
545 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  46.55 
 
 
545 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  46.86 
 
 
548 aa  478  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  51.96 
 
 
547 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>