29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0622 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  711    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1933  hypothetical protein  25.75 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.235318  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  25 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  26.93 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.67 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  23.84 
 
 
352 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  24.32 
 
 
366 aa  63.5  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  24.08 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  21.69 
 
 
352 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  24.91 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  21.93 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  20.14 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  21.64 
 
 
338 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  22.88 
 
 
342 aa  56.2  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  26.05 
 
 
342 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  25.25 
 
 
332 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  22.74 
 
 
347 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  24.14 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  24.1 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  26.97 
 
 
351 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  22.92 
 
 
338 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  24.6 
 
 
347 aa  46.6  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  25.17 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  25.17 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  20.87 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  25.51 
 
 
330 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  33.03 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  26.69 
 
 
330 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  43.64 
 
 
323 aa  42.7  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>