More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0353 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0353  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  859    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.326353 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  65.71 
 
 
754 aa  557  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  62.95 
 
 
757 aa  554  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  62.83 
 
 
771 aa  548  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  61.47 
 
 
761 aa  528  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  61.23 
 
 
755 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  60.71 
 
 
759 aa  519  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  59.34 
 
 
757 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  59.67 
 
 
766 aa  518  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  61.7 
 
 
763 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  60.34 
 
 
749 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  60 
 
 
749 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  56.26 
 
 
769 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0295  malic enzyme  56.03 
 
 
764 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0265  malic enzyme  56.03 
 
 
764 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.8165  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  61.25 
 
 
422 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  58.55 
 
 
752 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  57.91 
 
 
780 aa  482  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5783  malic enzyme  62.16 
 
 
422 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  58.6 
 
 
432 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66680  malic enzyme  62.41 
 
 
422 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  58.07 
 
 
752 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  56.26 
 
 
752 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  57.04 
 
 
759 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  57.04 
 
 
759 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  57.04 
 
 
759 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  57.04 
 
 
759 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  57.04 
 
 
759 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  59.95 
 
 
749 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2970  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  59.11 
 
 
412 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.017346  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  55.88 
 
 
751 aa  478  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  56.32 
 
 
759 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  60.19 
 
 
752 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  55.48 
 
 
769 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  55.45 
 
 
759 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  56.09 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  56.09 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  59.65 
 
 
422 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  56.09 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0824  malate dehydrogenase  59.25 
 
 
421 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00610824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  57.18 
 
 
779 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  56.09 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  56.09 
 
 
759 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  56.09 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  59.65 
 
 
425 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  56.34 
 
 
783 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  59.65 
 
 
425 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  56.09 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  56.09 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  55.45 
 
 
751 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  56.09 
 
 
759 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  55.45 
 
 
760 aa  471  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2300  malate dehydrogenase  59.5 
 
 
414 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  54.68 
 
 
757 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  59.65 
 
 
450 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  58 
 
 
771 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  58.9 
 
 
422 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  57.04 
 
 
773 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2328  malic enzyme  54.68 
 
 
775 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  59.4 
 
 
425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  57.76 
 
 
771 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3722  malic enzyme  54.55 
 
 
766 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2106  malic enzyme  55.26 
 
 
765 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12577  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0990  malic enzyme  55.85 
 
 
759 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3352  malic enzyme  55.56 
 
 
763 aa  465  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49326  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  59.52 
 
 
758 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  55.02 
 
 
764 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  55.37 
 
 
759 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3061  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  56.56 
 
 
440 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4217  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  57.93 
 
 
764 aa  467  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.665335  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  55.85 
 
 
759 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  55.85 
 
 
759 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  55.31 
 
 
760 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0461  malic enzyme  59.52 
 
 
758 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0951563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  56.35 
 
 
754 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  55.85 
 
 
759 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  57.93 
 
 
761 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  55.31 
 
 
756 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  55.31 
 
 
756 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  58.9 
 
 
422 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  55.31 
 
 
773 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2378  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  59.21 
 
 
406 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0813409  normal  0.0779687 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  55.31 
 
 
756 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  55.31 
 
 
756 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  60.33 
 
 
754 aa  463  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  55.31 
 
 
761 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  55.31 
 
 
756 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  55.31 
 
 
756 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  57.45 
 
 
763 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  55.56 
 
 
756 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  55.31 
 
 
756 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  55.56 
 
 
756 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0540  malate dehydrogenase  60.65 
 
 
422 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43250  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  58.37 
 
 
414 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.413003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  54.63 
 
 
758 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  54.33 
 
 
777 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1391  malic enzyme  56.56 
 
 
759 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.603057  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  52.61 
 
 
754 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2786  malic enzyme  56.56 
 
 
759 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0144029 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  55.31 
 
 
756 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>