More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1217 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1217  uracil-DNA glycosylase, family 4  100 
 
 
203 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.18 
 
 
249 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.67 
 
 
245 aa  102  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2660  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.24 
 
 
205 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.405963  normal  0.388577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.1 
 
 
271 aa  99.4  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.34 
 
 
315 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.98 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  35.66 
 
 
433 aa  95.9  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.85 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.15 
 
 
231 aa  95.5  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.41 
 
 
235 aa  94.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  35.66 
 
 
220 aa  94.7  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  35.66 
 
 
468 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  35.66 
 
 
455 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.29 
 
 
308 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.84 
 
 
185 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  35.29 
 
 
308 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.62 
 
 
341 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.2 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  35.66 
 
 
455 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  35.66 
 
 
455 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  35.66 
 
 
455 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  35.66 
 
 
455 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.86 
 
 
300 aa  93.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.86 
 
 
264 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.58 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.36 
 
 
358 aa  92.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.44 
 
 
304 aa  92.4  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.03 
 
 
285 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.44 
 
 
241 aa  92  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.66 
 
 
345 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07331  Uracil-DNA glycosylase  42.57 
 
 
187 aa  92  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.444861  hitchhiker  0.00512235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.66 
 
 
367 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.46 
 
 
184 aa  92  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.58 
 
 
187 aa  91.3  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.35 
 
 
305 aa  91.3  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4460  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.85 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0893  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.54 
 
 
227 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148707 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.22 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.17 
 
 
336 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.91 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07301  Uracil-DNA glycosylase  42.99 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.64 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  39.16 
 
 
213 aa  89.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.87 
 
 
208 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07710  uracil-DNA glycosylase, family 4  42.65 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.08 
 
 
209 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07281  Uracil-DNA glycosylase  42.06 
 
 
167 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3061  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.96 
 
 
255 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.66 
 
 
342 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.66 
 
 
346 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.55 
 
 
242 aa  90.1  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.66 
 
 
346 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.23 
 
 
264 aa  89.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.32 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  36.21 
 
 
264 aa  89.7  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0675  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.06 
 
 
167 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07481  Uracil-DNA glycosylase  41.12 
 
 
167 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14331  Uracil-DNA glycosylase  39.47 
 
 
183 aa  89  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.1 
 
 
276 aa  89  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.8 
 
 
199 aa  89  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  36.55 
 
 
292 aa  88.2  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.27 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.36 
 
 
259 aa  87.8  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1228  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.16 
 
 
276 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.55 
 
 
243 aa  87.8  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.41 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1351  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.46 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.5 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.29 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.57 
 
 
294 aa  86.7  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.55 
 
 
264 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0265  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.88 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.86 
 
 
264 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.71 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.5 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.08 
 
 
290 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.24 
 
 
195 aa  85.9  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.06 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.94 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1180  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.71 
 
 
187 aa  85.5  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.71 
 
 
295 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4766  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.93 
 
 
309 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4431  phage SPO1 DNA polymerase-like protein  38.76 
 
 
226 aa  85.5  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.696718  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0356  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.33 
 
 
225 aa  85.5  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.606658  normal  0.0957243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4616  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.93 
 
 
334 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.71 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.67 
 
 
253 aa  85.1  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.13 
 
 
190 aa  85.1  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.88 
 
 
264 aa  85.1  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4246  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.93 
 
 
323 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.95 
 
 
193 aa  84.7  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.95 
 
 
193 aa  84.7  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.66 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1297  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.76 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.53 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.5 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.52 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.26 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  37.24 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>