28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4277 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  99.18 
 
 
365 aa  697    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  95.1 
 
 
367 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  31.96 
 
 
387 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  30.83 
 
 
383 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  29.67 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  28.65 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  24.29 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  29.1 
 
 
387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  28.11 
 
 
381 aa  112  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  26.67 
 
 
389 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  27.76 
 
 
388 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  28 
 
 
389 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  26.05 
 
 
364 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  26.84 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  22.39 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  25.21 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  26.43 
 
 
361 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  29.6 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  25.92 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  28.32 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  25.63 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  23.18 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  28.15 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  19.95 
 
 
485 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  26.65 
 
 
409 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  27.33 
 
 
373 aa  57.4  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  22.31 
 
 
370 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>