More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2545 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1943  hypothetical protein  100 
 
 
583 aa  1196  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.94909e-10  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2551  hypothetical protein  68.17 
 
 
589 aa  826  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000314257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2361  peptidase, S16 (lon protease) family  58.05 
 
 
586 aa  708  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.51656e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1026  lon protease (S16) proteolytic domain protein  57.98 
 
 
586 aa  702  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.3789e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1598  hypothetical protein  67.65 
 
 
576 aa  808  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  9.47515e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1143  lon protease (S16) proteolytic domain-containing protein  57.8 
 
 
586 aa  701  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0143883  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1752  putative Lon protease  75.13 
 
 
590 aa  931  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.64824e-07  decreased coverage  6.03795e-07 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1564  peptidase S16 lon domain protein  66.09 
 
 
575 aa  793  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2860  hypothetical protein  67.13 
 
 
589 aa  814  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  7.2938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00966  hypothetical protein  58.22 
 
 
586 aa  710  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  5.57522e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1119  peptidase, S16 (lon protease) family  58.22 
 
 
586 aa  710  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  4.03379e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2165  S16 family peptidase  58.22 
 
 
586 aa  710  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.28937e-07  normal  0.352298 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1069  S16 family peptidase  58.22 
 
 
586 aa  710  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.6445e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2641  peptidase S16 lon domain-containing protein  58.05 
 
 
586 aa  710  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  7.12327e-07  hitchhiker  6.06295e-07 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1131  protease La homolog  57.63 
 
 
586 aa  700  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  5.0712e-05  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00959  predicted peptidase  58.22 
 
 
586 aa  710  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.59682e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2688  putative ATP-dependent protease  58.05 
 
 
586 aa  710  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.56121e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1467  putative ATP-dependent protease  57.19 
 
 
586 aa  706  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  1.04055e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1109  putative Putative protease La homolog  57.8 
 
 
586 aa  701  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000428257  hitchhiker  0.00783393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1177  protease La-like protein  57.98 
 
 
586 aa  703  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00123977  normal  0.54103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1064  S16 family peptidase  58.05 
 
 
586 aa  710  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20941e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2545  hypothetical protein  100 
 
 
583 aa  1196  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.89623e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2633  hypothetical protein  100 
 
 
540 aa  1107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  5.10666e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0411  hypothetical protein  52.51 
 
 
584 aa  632  1e-180  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.775698  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003444  ATP-dependent protease LA-related protein  40.48 
 
 
546 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.34026e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1090  hypothetical protein  43.78 
 
 
598 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02331  ATP-dependent protease  39.41 
 
 
546 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0858  ATP-dependent Lon protease  38.09 
 
 
603 aa  392  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  8.38018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1557  putative protease La homolog  43.52 
 
 
555 aa  379  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00224903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  43.06 
 
 
844 aa  325  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  41.48 
 
 
803 aa  324  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  38.7 
 
 
811 aa  310  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.67 
 
 
801 aa  308  2e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  37.44 
 
 
786 aa  306  9e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  39.6 
 
 
809 aa  305  1e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1546  ATP-dependent protease  39.78 
 
 
582 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000113225  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.82 
 
 
816 aa  300  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  40.9 
 
 
799 aa  299  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  37.67 
 
 
786 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1613  ATP-dependent protease  40.7 
 
 
582 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.99604e-05  normal  0.391845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  35.74 
 
 
807 aa  298  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  38.16 
 
 
861 aa  296  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.63 
 
 
802 aa  296  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1607  ATP-dependent protease  40.47 
 
 
582 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  6.44541e-07  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  38.08 
 
 
810 aa  294  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  39.81 
 
 
811 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.06 
 
 
812 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  39.63 
 
 
811 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  37.39 
 
 
791 aa  293  7e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  38.46 
 
 
812 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1857  ATP-dependent protease  41.73 
 
 
577 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  37.21 
 
 
786 aa  291  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  35.63 
 
 
777 aa  291  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  39.55 
 
 
812 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  38.43 
 
 
812 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.3 
 
 
813 aa  289  9e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  38.43 
 
 
812 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  41.57 
 
 
819 aa  288  3e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  39.54 
 
 
660 aa  287  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  35.56 
 
 
795 aa  285  1e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  35.62 
 
 
800 aa  285  2e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.51631e-05  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  40.55 
 
 
832 aa  284  3e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  39.47 
 
 
813 aa  284  3e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1037  peptidase S16 lon domain protein  34.88 
 
 
774 aa  284  4e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.350098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  40.09 
 
 
809 aa  283  5e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  37.24 
 
 
829 aa  283  6e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  2.80038e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1638  ATP-dependent protease  37.47 
 
 
577 aa  283  6e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00274053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  36.89 
 
 
805 aa  283  6e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  38.25 
 
 
818 aa  283  8e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  39.12 
 
 
817 aa  283  8e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  39.12 
 
 
817 aa  283  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.66 
 
 
805 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1780  conserved hypothetical ATP-dependent protease  39.58 
 
 
577 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.00505e-07  hitchhiker  0.000156228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2604  ATP-dependent protease  38.44 
 
 
577 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.49813e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2679  ATP-dependent protease  39.12 
 
 
577 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0066735  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  36.6 
 
 
805 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2564  ATP-dependent protease  38.89 
 
 
577 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.55632e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  38.12 
 
 
815 aa  280  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2464  ATP-dependent protease  42.86 
 
 
599 aa  279  8e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.27268e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  37.02 
 
 
808 aa  279  9e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  39.12 
 
 
806 aa  279  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  36.43 
 
 
806 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.36 
 
 
810 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  36.32 
 
 
797 aa  278  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  37.83 
 
 
803 aa  277  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  38.3 
 
 
814 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  37.56 
 
 
798 aa  278  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2149  ATP-dependent protease  41.18 
 
 
543 aa  278  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.59451e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.62 
 
 
805 aa  277  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.43 
 
 
805 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1606  ATP-dependent protease  43.31 
 
 
576 aa  276  7e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.40956e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.76 
 
 
806 aa  276  1e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  36.19 
 
 
805 aa  275  2e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2655  ATP-dependent protease  38.36 
 
 
596 aa  275  2e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.08 
 
 
843 aa  275  2e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.96 
 
 
805 aa  275  2e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.19 
 
 
805 aa  275  2e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  35.37 
 
 
814 aa  275  2e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  38.1 
 
 
825 aa  273  4e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1952  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.7 
 
 
570 aa  274  4e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>