More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2604 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1952  peptidase S16 lon domain-containing protein  56 
 
 		 570 aa  638    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1857  ATP-dependent protease  84.03 
 
 		 577 aa  1024    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1638  ATP-dependent protease  89.08 
 
 		 577 aa  1086    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00274053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1818  ATP-dependent protease  58.2 
 
 		 569 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1606  ATP-dependent protease  59.07 
 
 		 576 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000440956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2149  ATP-dependent protease  58.23 
 
 		 543 aa  675    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000159451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2464  ATP-dependent protease  67.99 
 
 		 599 aa  810    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000127268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1780  conserved hypothetical ATP-dependent protease  98.27 
 
 		 577 aa  1177    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000100505  hitchhiker  0.000156228 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2467  ATP-dependent protease  60.86 
 
 		 580 aa  721    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00344984  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2604  ATP-dependent protease  100 
 
 		 577 aa  1196    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000149813  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1546  ATP-dependent protease  84.55 
 
 		 582 aa  1029    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000113225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1613  ATP-dependent protease  84.9 
 
 		 582 aa  1033    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000299604  normal  0.391845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2655  ATP-dependent protease  68.23 
 
 		 596 aa  810    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2564  ATP-dependent protease  98.44 
 
 		 577 aa  1179    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000155632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2679  ATP-dependent protease  98.09 
 
 		 577 aa  1177    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0066735  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1607  ATP-dependent protease  85.24 
 
 		 582 aa  1041    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000644541  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  35.6 
 
 		 831 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  40.62 
 
 		 829 aa  308  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000280038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  36.43 
 
 		 827 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  39.69 
 
 		 817 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  35.28 
 
 		 786 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  39.73 
 
 		 811 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  37.42 
 
 		 818 aa  301  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  39.95 
 
 		 811 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02331  ATP-dependent protease  40.46 
 
 		 546 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  39.91 
 
 		 806 aa  299  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  39.46 
 
 		 817 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  38.95 
 
 		 832 aa  297  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.29 
 
 		 802 aa  296  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  40 
 
 		 786 aa  296  7e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  39.28 
 
 		 812 aa  296  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  38.27 
 
 		 844 aa  293  7e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  37.42 
 
 		 800 aa  293  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.09 
 
 		 812 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  37.01 
 
 		 803 aa  292  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003444  ATP-dependent protease LA-related protein  37.3 
 
 		 546 aa  291  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000734026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  39.09 
 
 		 812 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  39.09 
 
 		 812 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  39.09 
 
 		 812 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.53 
 
 		 807 aa  289  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  35.86 
 
 		 807 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  37.3 
 
 		 802 aa  287  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  38.25 
 
 		 813 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  36.25 
 
 		 811 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000135674  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  34.07 
 
 		 786 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.4 
 
 		 816 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  34.07 
 
 		 814 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  37 
 
 		 809 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.66 
 
 		 843 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  34.53 
 
 		 795 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  35.55 
 
 		 798 aa  280  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  35.23 
 
 		 821 aa  280  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  36.61 
 
 		 660 aa  279  8e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  33.88 
 
 		 825 aa  279  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0590  ATP-dependent protease, putative  36.44 
 
 		 811 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0118699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  34.66 
 
 		 805 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  35.61 
 
 		 811 aa  279  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.59 
 
 		 805 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  37.53 
 
 		 803 aa  277  4e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.45 
 
 		 805 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.45 
 
 		 805 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  35.64 
 
 		 861 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.59 
 
 		 805 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1557  putative protease La homolog  37.5 
 
 		 555 aa  276  8e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00224903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.59 
 
 		 810 aa  276  9e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  35.74 
 
 		 813 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  34.47 
 
 		 819 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1090  hypothetical protein  37.03 
 
 		 598 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.84 
 
 		 801 aa  273  6e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  34.68 
 
 		 819 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1943  hypothetical protein  38.44 
 
 		 583 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000294909  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.1 
 
 		 813 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2545  hypothetical protein  38.44 
 
 		 583 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.89623e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2633  hypothetical protein  38.44 
 
 		 540 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  34.74 
 
 		 799 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.5 
 
 		 806 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1752  putative Lon protease  37.69 
 
 		 590 aa  270  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164824  decreased coverage  0.000000603795 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.18 
 
 		 865 aa  269  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  33.96 
 
 		 805 aa  269  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.89 
 
 		 805 aa  269  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  37.89 
 
 		 809 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  35.41 
 
 		 815 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  37.5 
 
 		 795 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  33.96 
 
 		 805 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 		 873 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.96 
 
 		 805 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  33.75 
 
 		 806 aa  267  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  33.55 
 
 		 817 aa  267  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  36.24 
 
 		 808 aa  266  5.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  35.44 
 
 		 791 aa  266  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.48 
 
 		 806 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  41.93 
 
 		 784 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  34.68 
 
 		 810 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  33.41 
 
 		 786 aa  266  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  34.74 
 
 		 823 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  33.55 
 
 		 777 aa  264  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.03 
 
 		 788 aa  264  4e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  33.47 
 
 		 803 aa  261  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1564  peptidase S16 lon domain protein  37.19 
 
 		 575 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  33.26 
 
 		 806 aa  259  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>