More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2860 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_00966  hypothetical protein  53.63 
 
 		 586 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000557522  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00959  predicted peptidase  53.63 
 
 		 586 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000259682  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2688  putative ATP-dependent protease  53.63 
 
 		 586 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000256121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2860  hypothetical protein  100 
 
 		 589 aa  1211    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000072938  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1119  peptidase, S16 (lon protease) family  53.63 
 
 		 586 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000403379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2551  hypothetical protein  94.91 
 
 		 589 aa  1163    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000314257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2545  hypothetical protein  67.13 
 
 		 583 aa  807    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.89623e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1467  putative ATP-dependent protease  54.5 
 
 		 586 aa  654    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000104055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1752  putative Lon protease  69.15 
 
 		 590 aa  835    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164824  decreased coverage  0.000000603795 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2633  hypothetical protein  67.86 
 
 		 540 aa  753    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1943  hypothetical protein  67.13 
 
 		 583 aa  807    Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000294909  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1064  S16 family peptidase  53.63 
 
 		 586 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20941e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2165  S16 family peptidase  53.81 
 
 		 586 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000228937  normal  0.352298 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1564  peptidase S16 lon domain protein  73.39 
 
 		 575 aa  889    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1069  S16 family peptidase  53.63 
 
 		 586 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000026445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2641  peptidase S16 lon domain-containing protein  53.63 
 
 		 586 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000712327  hitchhiker  0.000000606295 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2361  peptidase, S16 (lon protease) family  53.63 
 
 		 586 aa  640    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.000000000000251656  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1598  hypothetical protein  73.7 
 
 		 576 aa  900    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000947515  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1177  protease La-like protein  53.11 
 
 		 586 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00123977  normal  0.54103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1109  putative Putative protease La homolog  52.94 
 
 		 586 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000428257  hitchhiker  0.00783393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1026  lon protease (S16) proteolytic domain protein  52.77 
 
 		 586 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023789  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1131  protease La homolog  53.11 
 
 		 586 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000050712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1143  lon protease (S16) proteolytic domain-containing protein  52.94 
 
 		 586 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0143883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0411  hypothetical protein  49.22 
 
 		 584 aa  600  1e-170  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.775698  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003444  ATP-dependent protease LA-related protein  40.24 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000734026  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1090  hypothetical protein  41.52 
 
 		 598 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02331  ATP-dependent protease  38.99 
 
 		 546 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0858  ATP-dependent Lon protease  39.63 
 
 		 603 aa  392  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000838018  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1557  putative protease La homolog  44.44 
 
 		 555 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00224903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  41.31 
 
 		 803 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  43.62 
 
 		 844 aa  316  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  43.58 
 
 		 660 aa  309  8e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  40.44 
 
 		 809 aa  300  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  39.71 
 
 		 811 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.1 
 
 		 801 aa  297  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  42.2 
 
 		 809 aa  294  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  36.13 
 
 		 810 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  36.6 
 
 		 786 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  40.34 
 
 		 813 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.7 
 
 		 802 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  36.31 
 
 		 808 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  35.52 
 
 		 786 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  36.13 
 
 		 786 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  37.06 
 
 		 807 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  39.42 
 
 		 811 aa  283  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.88 
 
 		 816 aa  282  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  39.02 
 
 		 861 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  40 
 
 		 813 aa  282  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  39.08 
 
 		 811 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  38.64 
 
 		 818 aa  279  8e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.87 
 
 		 843 aa  279  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  38.78 
 
 		 812 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.78 
 
 		 812 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  38.78 
 
 		 812 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  38.78 
 
 		 812 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  37.13 
 
 		 798 aa  276  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.36 
 
 		 805 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  37.79 
 
 		 812 aa  276  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1056  peptidase S16, lon-like  37.2 
 
 		 975 aa  276  8e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  40.37 
 
 		 819 aa  276  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  39.29 
 
 		 832 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  34.14 
 
 		 777 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1322  hypothetical protein  36.73 
 
 		 951 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.13 
 
 		 805 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1447  ATP-dependent protease, putative  40.37 
 
 		 806 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  36.13 
 
 		 805 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.52 
 
 		 810 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  36.03 
 
 		 795 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.36 
 
 		 805 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  35.98 
 
 		 806 aa  274  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.28 
 
 		 805 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1952  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.56 
 
 		 570 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000193929  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  35.75 
 
 		 805 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1818  ATP-dependent protease  38.48 
 
 		 569 aa  273  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  35.51 
 
 		 805 aa  273  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  36.53 
 
 		 814 aa  273  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.51 
 
 		 805 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  38.8 
 
 		 803 aa  273  9e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  34.41 
 
 		 800 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  38.02 
 
 		 817 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  39.42 
 
 		 806 aa  271  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  38.02 
 
 		 817 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  35.92 
 
 		 810 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.62 
 
 		 788 aa  270  4e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  34.51 
 
 		 791 aa  270  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  37.32 
 
 		 811 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000135674  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  38.31 
 
 		 802 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1606  ATP-dependent protease  40.98 
 
 		 576 aa  269  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000440956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  37.9 
 
 		 821 aa  267  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  37.93 
 
 		 829 aa  267  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000280038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  36 
 
 		 797 aa  267  5e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  38.61 
 
 		 799 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  37.64 
 
 		 819 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1546  ATP-dependent protease  37.76 
 
 		 582 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000113225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  37.47 
 
 		 814 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  37.74 
 
 		 795 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  37.19 
 
 		 819 aa  265  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2464  ATP-dependent protease  38.44 
 
 		 599 aa  264  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000127268  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1613  ATP-dependent protease  37.67 
 
 		 582 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000299604  normal  0.391845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2149  ATP-dependent protease  37.7 
 
 		 543 aa  264  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000159451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>