116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0572 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  98.59 
 
 
3350 aa  1243    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  78.34 
 
 
2588 aa  937    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  77.71 
 
 
2530 aa  930    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
658 aa  1311    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  78.03 
 
 
2545 aa  934    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  50.91 
 
 
3322 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  47.55 
 
 
2600 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  47.37 
 
 
2345 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  42.16 
 
 
2421 aa  395  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  42.13 
 
 
1998 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.96 
 
 
3475 aa  348  2e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  39.93 
 
 
3147 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  39.15 
 
 
3141 aa  346  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  51.42 
 
 
4966 aa  344  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  38.98 
 
 
3144 aa  343  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  38.64 
 
 
3131 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.94 
 
 
3480 aa  337  5e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.94 
 
 
3378 aa  337  5.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  39.02 
 
 
3141 aa  336  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  39.02 
 
 
3141 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.52 
 
 
3020 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  38.98 
 
 
3501 aa  334  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  38.56 
 
 
3552 aa  332  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  40.93 
 
 
2984 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.43 
 
 
3028 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.54 
 
 
3602 aa  322  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  40.14 
 
 
3004 aa  320  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.86 
 
 
3079 aa  319  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.07 
 
 
2782 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  41.45 
 
 
3301 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  38.04 
 
 
3159 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  53.85 
 
 
3526 aa  300  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  46.86 
 
 
3884 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  46.19 
 
 
3785 aa  283  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  35.5 
 
 
3165 aa  270  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  36.72 
 
 
3443 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  35.68 
 
 
5212 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  35.04 
 
 
3081 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  37.53 
 
 
594 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  44.44 
 
 
6274 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  37.39 
 
 
3563 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  35.76 
 
 
2758 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.7 
 
 
3040 aa  240  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.12 
 
 
3128 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.03 
 
 
3862 aa  230  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.71 
 
 
1730 aa  223  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.14 
 
 
428 aa  220  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.93 
 
 
2670 aa  217  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.88 
 
 
5981 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.44 
 
 
3967 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.89 
 
 
3796 aa  208  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  39.1 
 
 
2449 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  47.15 
 
 
3790 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.93 
 
 
1723 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  35.75 
 
 
2827 aa  190  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  36.49 
 
 
812 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  39.39 
 
 
1719 aa  180  9e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  40.26 
 
 
1270 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  39.73 
 
 
2350 aa  179  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0071  hemagglutinin-related protein  35.56 
 
 
541 aa  173  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.67 
 
 
721 aa  170  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  34.44 
 
 
463 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.5 
 
 
923 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4128  hypothetical protein  33.33 
 
 
463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0784897  normal  0.299338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0085  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 
463 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.741703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  30.68 
 
 
2536 aa  147  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  37.68 
 
 
1489 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  29.32 
 
 
2737 aa  140  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.47 
 
 
1615 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  32.7 
 
 
3929 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  34.83 
 
 
1635 aa  137  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  36.04 
 
 
1618 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  31.91 
 
 
1841 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.5 
 
 
2786 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.75 
 
 
1508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  31.19 
 
 
905 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  31.19 
 
 
905 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.41 
 
 
2818 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  29.92 
 
 
2751 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  34.83 
 
 
1651 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  28.7 
 
 
914 aa  127  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.57 
 
 
1508 aa  127  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  30.94 
 
 
911 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.58 
 
 
2666 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  32.82 
 
 
2691 aa  125  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  30.52 
 
 
1745 aa  125  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6763  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.18 
 
 
678 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198523  normal  0.504968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5359  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.5 
 
 
678 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.627453 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  34.13 
 
 
893 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  31.81 
 
 
898 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  34.13 
 
 
901 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.12 
 
 
1508 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0152  filamentous haemagglutinin  31.39 
 
 
716 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3183  hemagglutinin-like signal peptide protein  29.53 
 
 
846 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855089  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2933  filamentous haemagglutinin, N-terminal  27.68 
 
 
849 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30 
 
 
2847 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7335  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.44 
 
 
681 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.989933  normal  0.505585 
 
 
-
 
NC_003296  RS04813  hemagglutinin-like signal peptide protein  32.16 
 
 
846 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.565889  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5443  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.37 
 
 
730 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.34159  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5056  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.65 
 
 
847 aa  104  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776969  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>