35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1608 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  77.89 
 
 		 534 aa  826    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  78.78 
 
 		 525 aa  832    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  98.4 
 
 		 560 aa  1140    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  100 
 
 		 561 aa  1165    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  50.98 
 
 		 503 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  49.49 
 
 		 474 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  53.38 
 
 		 505 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  45.52 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  45.27 
 
 		 443 aa  372  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  41.99 
 
 		 444 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  40.71 
 
 		 444 aa  334  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  41.89 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  41.45 
 
 		 439 aa  329  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  36.41 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  33.68 
 
 		 929 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  35.62 
 
 		 450 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  35.7 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  34.83 
 
 		 423 aa  237  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  35.35 
 
 		 396 aa  229  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.37 
 
 		 1967 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  28.51 
 
 		 424 aa  191  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  28.08 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  28.01 
 
 		 432 aa  173  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  27.99 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  27.43 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  26.48 
 
 		 556 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  27.68 
 
 		 555 aa  163  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  26.52 
 
 		 441 aa  160  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  26.1 
 
 		 460 aa  156  7e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  26.2 
 
 		 733 aa  154  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  26.85 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  26.05 
 
 		 457 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  28.87 
 
 		 412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  23.15 
 
 		 2716 aa  44.3  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  31.82 
 
 		 2929 aa  43.5  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>